인간의 순수 수면시간을 계산해보면 평균적으로 26년 정도 잔다고 한다. 인생에서 잠은 가장 많은 시간을 차지하기도 하지만 그만큼 몸의 회복에 중요한 시간이다.
수면이 부족하면 면역력과 활동성이 떨어진다고 한다. 밤잠을 설치면 다음 날 업무에 지장을 줄 뿐만 아니라 만성피로에 노출되고 많이 자도 무기력증을 호소하곤 한다. 적당한 수면을 통해 우리의 건강을 지키는 한편, 어떻게 하면 숙면을 취할 수 있는지에 대해서 알아보고자 한다.

숙면, 단순한 잠이 아닌 우리 몸의 건강을 위한 필수조건

수면이 부족하면 면역력에도 좋지 않은 영향을 주게 되어 암세포나 바이러스 등에 면역질환에 취약해지고 백혈구의 활동성이 떨어지는 것으로 알려져 있다. 수면시간과 수명과의 연관관계를 조사한 국내외 연구 사례들을 살펴보면 하루 평균 8시간 정도 숙면을 취하는 것이 건강에 좋다고 한다. 8시간 수면시간 외에도 밤 11시~새벽 2시 사이에 잠자리에 드는 것이 중요하다. 유아기와 청소년기에는 성장호르몬이 성장에 관여하지만 성인이 된 후에 분비되는 성장호르몬은 몸의 신진대사와 인체 기능 회복 역할을 담당하기 때문이다.

그럼 구체적으로 연령에 따라 조금씩 다른 '최적의 수면시간'에 대해서 알아보도록 하자. 보통 대부분의 사람들이 최적의 수면시간을 7시간에서 8시간이라고 알고 있다. 과유불급이라는 말처럼 너무 오래 자도, 적게 자도 질병 위험이 커진다고 한다. 미국 국립수면연구재단에서 제공하는 연령별 권장 수면 시간을 보면 1살에서 2살은 12시간에서 14시간, 6살에서 13살은 9시간에서 11시간, 18살에서 25살은 7시간에서 9시간, 26살 이상은 7시간에서 8시간이 좋다고 한다. 만약 권장 수면 시간보다 1∼2시간 이상 적거나 많으면, 비만과 심뇌혈관질환, 치매, 당뇨병 같은 질환의 위험도 커진다고 하는데, 특히 불면증이나 수면무호흡증 같은 수면 장애가 있는 남성은 전립선암 발병률이 2배 이상 높아진다고 한다. 그럼 이 중에서도 어느 시간대에 꼭 수면해야 하는지에 대해서 알아보며, 또한 수면에 미치는 호르몬과 이를 조절할 수 있는 조절제에 대해서 소개해보도록 하겠다.

꼭 수면해야할 시간대 오후 11시 ~ 새벽 2시

멜라토닌은 뇌간에 위치한 송과체에서 생성되는 수면조절 호르몬일 뿐 아니라 콩팥 위의 부신에서 만들어지는 스테로이드 호르몬인 DHEA(Dehydroepiandrosterone), 면역세포를 만드는 티뮬린(Thymulin), 남성호르몬인 테스토스테론(Testosterone), 여성호르몬인 에스트로겐(Estrogen), 그리고 인체의 저항력을 높여주는 인터류킨(Interleukin) 등의 조절에도 관여하고 있어 매우 중요하다. 나이가 들수록 멜라토닌의 생성이 저하되기 때문에 수면시간이 줄어들고 잠의 질도 떨어진다. 그래서 노인들의 경우 멜라토닌의 분비가 왕성해지는 밤 11시부터 새벽 두세 시까지는 수면에 어려움이 없으나 멜라토닌의 분비가 급격하게 줄어드는 새벽녘에 잠이 깨면 쉽사리 잠들지 못한다.

수개월 동안 어둠이 내리지 않고 백야(白夜)현상이 지속되는 북유럽 사람들이 불면증을 해소하기 위해 애용하는, 일반 우유보다 멜라토닌 함량이 3~4배나 많이 들어 있는 ‘나이트 밀크’라는 게 있다. 핀란드에서 개발된 이 우유는 멜라토닌의 분비가 절정에 이르는 새벽 두 시경에 젖소에서 짠 숙면에 도움이 되는 기능성 식품이다. 이 우유는 유럽은 물론 일본에서도 불면증 환자들에게 수면제 대용으로 애용되고 있는 추세이다. 이 우유의 특징은 바로 멜라토닌의 분비가 왕성한 11시에서 새벽 2시를 활용한 것이다. 이 때문에 숙면에 절대적인 멜라토닌의 분비가 왕성해지는 밤 11시 이전에는 잠자리에 들어야 양질의 수면을 취할 수 있다.

숙면을 유도하는 생활 속 관리법

이렇게 수면을 취하기 힘든 현대인들은 수면장애를 많이 겪고 있다. 따라서 수면장애로 인해 어려움을 겪는 현대인들에게 수면의 질을 높이고 숙면에 도움이 되는 숙면을 위한 건강한 습관을 알아보도록 하자.

1. 낮 시간 햇살을 받으며 30분가량 산책하기
수면을 좌우하는 멜라토닌이라는 호르몬 물질은 낮 동안 받는 햇볕과 연관성이 크다. 낮 동안 일광을 쬐지 못하면 수면을 조절하는 멜라토닌 분비가 제대로 이루어지지 않아 수면 시 숙면을 취하는데 문제가 생길 수 있다.

2. 늦게 자더라도 일어나는 시간은 일정하게
보통 과음을 하거나 늦게 귀가한 날, 늘어지게 자려고 하는 경우가 많다. 물론, 피로회복에 수면만큼 좋은 것은 없지만 이렇게 불규칙한 수면패턴이 반복되면 수면장애를 유발할 수 있다. 낮잠도 하루 30분 이상을 넘기지 않는 것이 좋고 일어나는 시간은 늦게 자더라도 동일하게 패턴을 맞추도록 한다.

3. 자기 1시간 전 TV와 스마트폰 사용 최대한 자제하기
주로 스마트폰에서 많이 나오는 푸른빛의 블루라이트가 수면 호르몬이라고 할 수 있는 ‘멜라토닌’의 분비를 억제해 수면을 방해한다. 잠자리에 든 후에도 푸른빛에 많이 노출되면 멜라토닌을 분비하는 두뇌에서 ‘낮’이라고 인지해 수면을 방해하게 된다. 취침 1~2시간 전에는 스마트폰뿐만 아니라 각종 TV 등 전자기기는 최대한 멀리하도록 한다.

4. 늦은 저녁 시간에 격한 운동을 하지 않기
잠이 안 온다고 오히려 저녁에 근력운동이나 달리기와 같은 강도 높은 운동을 하는 경우도 있는데, 이는 오히려 교감신경을 자극해 숙면을 방해한다. 최소 운동은 자기 3시간 전에 끝내고 자기 전에는 몸을 이완해 줄 수 있는 간단한 체조나 스트레칭으로 긴장을 풀어주도록 한다.

5. 자기 3시간 전 과식 및 과음하지 않기
자기 전 과식이나 야식을 먹게 되면 몸속에 유해산소와 독소들을 생성시키고 소화가 되지 않은 상태로 수면에 들 경우 숙면을 취하기 어려워 되도록 자제하는 것이 좋다. 또한, 불면 증세가 있다면 차라리 저녁을 가볍게 먹고 생수를 한잔 마시고 자는 것이 수면에 도움이 된다. 보통 술을 마시면 정신이 몽롱해지면서 깊이 잠을 자는 것처럼 느끼지만, 음주 후 3시간가량은 깊은 잠을 자지만 그 이후부터는 자주 깨고 얕은 잠을 자게 되는 경우가 많다. 또한, 카페인이 함유된 커피, 초콜릿, 녹차 등 도 수면에 방해되기 때문에 오후 시간에는 삼가는 것이 좋다.

수면은 심리적인 영향을 많이 받기 때문에 마음을 편안하게 하는 것이 가장 효과적이다. 하지만 현대인이라면 스트레스 없이 살아갈 수 없으니 숙면을 위해 생활관리에 힘쓰도록 해야 한다.

필자는 잠자는 시간이 아까울 때가 있었다. 수면을 취하는 시간보다 업무와 개인적인 시간을 보내게 되는 경우가 많다. 하지만 그 다음 날 업무의 지장은 물론 졸음운전으로 이어질 때가 자주 있다. 나와 가족의 건강을 위해 잠자는 시간만큼은 나에 대한 투자로 생각하고 충분한 수면을 통해 숙면을 취할 수 있어야겠다.

Reference : 자생한방병원 건강컬럼, 밤 11시 이전에 꼭 잠을 자야만 하는 이유(최상용),
숨수면클리닉(image1), Health & Beauty blog at your fingertips(image2)

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그 바이오, 생명과학 분야에서 요즘 핫한 키워드가 하나 있다. 바로 [유전자 가위]인 [크리스퍼]이다. 가히 혁명이라고도 하고 황금알을 낳는 기술이라고도 한다. 이 기술을 활용하여 질병 분야에 상용화할 수 있다면 돈방석에 앉게 된다고 한다(물론 윤리적인 문제는 번외로 하더라도).

유전자 가위, 즉 우리의 유전 물질인 유전자를 가위로 싹둑싹둑 잘라내서 재단할 수 있게 하는 도구이다. 우리가 생체 내에 있는 유전자를 조작하기 위한 시도는 1970년대 후반 처음 시작되었다고 한다. 바로 제한효소[Restriction enzyme]의 발견 때문이다. DNA의 특정 부위를 인식해 그 부위를 자르는 제한효소로 인해 DNA를 자르고 붙이고 이어 붙이는 유전자 조작기술이 탄생한다. 그러나 제한효소는 특정 DNA 서열만을 인식하고, 인식 부위가 6-8bp로 매우 작은 부위만을 인식해 자르기 때문에 유전서열을 구분하는 경우의 수가 적어 제한적으로 사용되어져 왔다. 이러한 제한효소의 한계 때문에 전체 유전체 길이가 수천 bp인 작은 생물 내에서만 유용하게 활용될 수 있었다.

제한 효소로 유전자 조작을 통해 특정 질병을 대상으로 유전자 조작을 하고자 한다면 정확하게 필요한 부위를 잘라내야 하는데 정밀하게 원하는 부위에 작용 해서 절단한다고 장담할 수 없다. 왜냐면 우리 염기 서열은 A, T, G, C의 네 가지로 구성되어 있기 때문에 6bp를 인식하다면 4,096의 경우의 수를 인식하게 되고 8bp라면 65,536개를 판별할 수 있게 된다. 그러나 우리 사람은 약 30억 염기 서열로 되어 있는데 제한효소가 인식하는 부위가 단 한 곳에서만 있다고 볼 수 없다. 반복 부위가 있기 때문에 이 부위에서 모두 절단되어 버리고 새로운 염기서열로 대체하게 되면 우리 몸의 구성은 누구도 상상할 수 없는 일이 발생하게 될 것이다.

이러한 제한 효소의 단점 때문에 새로운 유전자 조작을 하기 위하여 징크핑거(Zinc-Finger)와 탈렌(TALEN)등을 통해 새로운 유전자 가위로 활용하려는 시도가 있었다. 그러나 이러한 대체재도 인식부위가 10bp로 짧아서 활용성과 효과 면에서 낙제점을 받을 수밖에 없었다.

그러다 크리스퍼(CRISPR)라고 하는 세균에서 새로운 유전서열을 발견하게 된다. 최근 들어 이 부위가 각광을 받게 되었지만, 이 부위는 이미 1987년에 일본에서 발견되었다고 한다.

크리스퍼는 '주기적 간격으로 분포하는 짧은 회문(Palindrome)구조의 반복 서열'(CRISPR, Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)이다. 시퀀싱 기술의 발달 덕분에 많은 유전체가 해독되고 이를 이용하여 새로운 기술을 개발해내려는 시도가 이루어지게 된다. 그 중에서 상대적으로 길이고 짧고 해독하기 쉬운 세균의 유전체도 밝혀지게 되는데 세균의 서열 중에 특이한 회문 구조를 가진 부위를 발견하게 된다. 이는 두 회문 서열 사이에 세균의 서열이 아닌 전혀 다른 21bp의 서열을 가진 특이한 서열을 가진다고 한다.

바이러스는 숙주를 감염시킬 때 자신의 DNA를 세포 내에 주입하고 숙주의 DNA 서열에 바이러스 자신의 DNA를 끼워 넣는다.

바이러스의 일부 서열을 뽑아서 회문 구조 사이에 21bp로 저장했다가 이를 나중에 바이러스의 서열과 비교하여 일치하는 부위가 있다면 이를 인식하여 잘라버려 바이러스를 제거하는 것이다. 물론 제한된 시간 내에 세균이 이를 처리해야 한다. 만약 살아남은 세균이 있다면 이는 후대에 유전되어 다음 세대에서는 면역력을 갖추게 된다. 세균이 바이러스의 서열을 찾아내면 캐스나인(Cas9)이라는 단백질이 바이러스를 분해시킨다. 유전 물질인 DNA는 RNA로 전사되고 이 RNA가 다시 단백질로 번역되는데 Cas9이 바이러스의 DNA가 RNA로 전사되면 그 RNA를 인식하여 잘라버리는 가위 역할을 하게 된다. 중요한 것은 이 인식부위가 제한효소나 Zinc-Finger와 달리 길이가 21bp이기 때문이다. 21bp 부위를 인식한다는 이야기는 4,398,046,511,104의 경우를 구분해 낼 수 있어서 정확한 부위를 탐지하여 손상 혹은 변이된 서열을 찾아내서 잘라내고 치환시킬 수 있게 된다.

이러한 크리스퍼의 발견 덕분에 유전자 조작이 손쉽게 가능해졌다. 즉 수정란에 Cas9과 RNA를 주입함으로써 간편하게 새로운 형질을 가질 수 있도록 유전자 조작이 가능해진 것이다.

이러한 크리스퍼-캐스나인 기술이

• 암과 에이즈 등 난치병 치료
• 고기능의 GMO 작물 개발
• 멸종 동물의 복원

등에 적용 가능해지면서 이 유전자 가위 기술이 주목받게 된 것이다. 더불어 인간은 인간을 포함한 거의 모든 생명체의 유전자를 조작할 수 있는 슈퍼 가위를 가지게 되었고 이는 가히 신의 영역에 접근하게 되었다는 것을 의미한다.

물론 바이오 분야에서 지속적으로 제기되는 윤리적인 문제뿐만 아니라, 이 유전자 가위로 유전자를 조작하였을 때 DNA 복구 과정이나 혹은 표적에서 벗어나 유전자가 잘리는 등의 부작용에 대한 문제도 해결되어야 한다.

이러한 유전자 가위 기술이 난치병이나 생물 다양성 복구 등 많은 문제를 해결해 인류의 건강과 복지를 증진시킬 수 있다는 기대감이 설레게 한다.

그러나 유전자 가위기술이 상용화되고 안정화되었을 때를 상상해 본다면...

영화의 배경이 되는 우주항공회사, 가타카(Gattaca)의 가장 우수한 인재인 제롬 머로우는 외모, 능력, 지식, 우성유전자를 가진 10점 만점에 9.3점의 점수를 가진 우수한 인재다. 자신의 꿈이자 토성의 위성 타이탄을 탐사하러 가게 될 임무 대기 중이던 어느 날, 탐사 감독관이 살해되게 되면서 살해범을 찾는 수사가 진행된다. 이때 주인공은 자신의 가짜 신분이 노출될까봐 노심초사하게 된다.

사실 그는 제롬 머로우가 아니라 빈센트 프리맨으로, 위조된 신체조직을 통해 우월한 유전자를 가진 '적격자' 신분을 획득하게 된 가짜 제롬이다. 즉 그는 엄격한 선발제도를 가진 가타카에 입사할 수 없는 '부적격자' 신분인 빈센트이기 때문이다.

• 주) 적격자, 부적격자: 유전자 판별 시스템으로 인간의 질병, 성격, 건강상태, 예상 수명을 판별하여 적격자와 부적격자로 구분함.

그 이유는 부모님의 사랑으로 태어난 아이 빈센트는 유전검사를 통해 약한 심장과 근시가 있게 되며 30살 즈음에 죽게 된다는 예측시스템 아래 그는 '부적격자'로 분류되어 사회에서 하급 인생을 살아야 하는 운명을 가졌다.

당시의 사회는 유전공학과 우생학을 기반으로 '유전자 조작'을 통해 태어난 아이와 자연으로 생긴 아이를 구분하여 사회적 지위를 구분하는 사회였다. 부모의 자연 임신 때문에 상대적으로 열성인 유전자를 가지고 태어난 아이는 질병, 성격, 수명 등에서 상대적으로 열세하다고 판단하며, 유전자 조작으로 부모의 유전자 중 해가 되는 돌연변이를 제거 후 우성 유전자만을 가진 아이는 상대적으로 우월한 등급을 받을 수 있는 유전자 기반의 계급사회다. 시스템에 의해 부적격자로 분류된 빈센트는 그 후 정말로 근시 때문에 안경을 쓰게 되고, 유전자 조작으로 태어난 동생 안톤보다 키도 작고 체력적으로 열세이며 부모에게서도 차별받는다. 그러다 우주 탐사라는 꿈을 안고 성장하게 되고 마지막으로 늘 동생에게 지기만 했던 수영경기에서 노력과 정신력으로 동생을 이기고 자신의 꿈을 찾아 집을 떠나버린다. 예정된 그의 운명과 신분 때문에 어떤 시험이나 면접에서도 통과할 수 없기 때문에.

결국, 우주항공회사에서 청소부 생활로 전전하던 중 꿈을 포기할 수 없었던 빈센트는 위험한 도박을 벌이게 된다. 바로 유전적으로 열성한 사람 즉 부적격자에게 가짜 증명서를 파는 신분 세탁 중개인을 통해 신분 상승을 꿈꾸게 되고 중개인의 소개로 유진 머로우와 만나게 된다. 즉 유전자를 팔려는 유진과 제공받은 유전자를 통해 신분 상승을 꿈꾸는 빈센트에게는 최상의 선택인거다. 유진이 가진 유전적 우성 인자는 빈센트를 좌절하게 했던 시험과 면접을 통과 시켜 줄 것이고 유진에게는 돈을 벌어 생계를 유지할 수 있었으니.

결국 꿈을 이루기 위하여 유진의 가짜 샘플을 자신의 샘플로 조작하여 피 한 방울, 머리카락, 타액 등으로 인간의 우월성을 판별하는 시스템과 사회를 속이면서 가타카에 입사하게 된다. 비록 겉으로는 큰 키에 잘생긴 외모를 가졌지만, 유전적으로는 여전히 심장 질환과 근시의 유전자를 가진 상태로. 이후 탐사 임무 대기 중 감독관이 살해되면서 일어나는 일들을 드라마화한 영화다.

영화의 제목 가타카(Gattaca)는 DNA 염기서열인 아데닌(A), 티민(T), 구아닌(G), 사이토신(C)으로 되어 있는데 DNA에서 작명한 것이라고 한다. 당시의 시스템과 사회는 유전적으로 우성인자를 가진 즉, 오직 유전자로만 신분이 결정되는 사회가 된다. 유전자 조작이 자유롭게 가능하므로 부모와 의사는 태어나기도 전에 우수한 우성 유전자만 남겨 두고, 열등한 열성인자는 제거하여 질병 노출 등 결점이 될 수 있는 유전자는 미리 제거하고 우수한 신체 조건을 가진 '인공아이'를 낳게 된다. 자연스럽게 우성 vs 열성이라는 두 유전적 차이로 '적격자'와 '부적격자'로 구분되는 사회가 되어 버린다. 물론 유전자 조작을 통해 태어난 아이만 적격자가 되는 것은 아니다. 유전자 조작 없이도 준수한 외모와 머리가 좋은 사람은 적격자가 된다. 다만 유전자 조작을 하는 이유는 부적격에 해당하는 요소들을 미리 제거하고 태어나는 것이 '적격자'가 될 확률이 훨씬 높을 거로 생각하기 때문이다.

• 주) 유전정보 제공자의 이름인 유진 머로우 중 유진(Eugene)은 우성 유전자를 뜻하기도 한다. 즉 우수한 유전자를 가진 사람이라서 아마도 유진 머로우 라고 이름 지었을 것이다. 생물학자들이 자주 사용하는 BLAST 프로그램을 개발한 사람도 유진 마이어(Eugene Myers)인데 이분도 우월한 유전자를 타고난 사람일까?

사람의 피 한 방울로 그 적합성을 점수로 판단하여 연애 상대 혹은 채용 대상자로 분류할 수 있게 되었고 돈만 내면 병원에서 부모에게서 받은 정자와 난자에서 유전자를 수정하고 편집하여 결함을 제거해준다. 물론 더 많은 돈을 낸다면 제삼자로부터 제공된 우수한 유전자를 삽입시킬 수도 있다.

이 영화가 우리에게 시사하는 바는 그냥 영화로만 간과하고 지나칠 부분은 아닌 것 같다. 질병 해방, 유전자 조작기술의 윤리적 문제, 차별과 계급사회, 인간의 무한한 발전 가능성 등 많은 메시지를 담고 있기 때문이다. 유전자 조작기술의 발달은 질병으로부터의 독립과 해방이라는 희망의 메시지를 주기도 하지만 그로 파생될 사회의 변화도 예의주시하고 대비하여야 할 것이다. 마지막으로 영화의 명대사로 이 글을 마무리하고자 한다.

"THERE IS NO GENE FOR THE HUMAN SPIRIT"

작성자 : BS실 이규열 부실장

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2016년 12월 23일 크리스마스 분위기가 물씬 풍기는 날, 한 해의 마무리를 하는 人Co 2016년 송년회 행사가 있었습니다. 송년회 행사 시작 전부터 대전지사, 파견근무 중이신 분들도 모두 모여 화기애애한 분위기였습니다. 갓 입사한 필자는 모두 처음 뵙는 분들이었지만 반갑게 맞아주셔서 정말 감사하고 人Co인들의 따뜻함을 느낄 수 있었습니다.
송년회는 人CoFLEX에 모두 모여 시작되었습니다.



이후 사장님의 기념사와 함께 2017년 개편되는 조직도를 보여주셨고, 모두들 앞으로 회사가 나아갈 방향을 파악하시느라 여념이 없으셨습니다.

이후 업무를 정리하고 송년회 일정 중 하나인 영화 관람을 하러 갔습니다. 필자의 경우는 이번이 첫 행사 참여였는데요, 송년회에서 영화를 보는 것도 신선했고 人Co인들과 함께라서 정말 즐겁게 영화를 볼 수 있었습니다. 관람한 영화는 마스터였는데요. 강동원, 김우빈, 이병헌 등 잘생기고 연기 잘하는 배우들이 열연한 영화라서 그런지 정말 재미있게 관람했습니다.



영화관람 후 단체기념사촬영시간! 카메라를 다루는데 부족한 실력의 필자로 인해 사진이 제대로 나오지 않아 당황했었는데요, 다행히 핸드폰으로 찰칵!

영화 관람 후 송년회의 꽃, 회식장소인 하남돼지집에 모두 모였습니다.
하남돼지집은 소문난 맛집이었는데요, 보기만해도 맛있어 보이는 비쥬얼에 감탄했습니다.




송년회 회식의 시작은 강전모 선배님의 사회로 진행되었습니다.



먼저 사장님의 좋은 말씀과 함께 건배!



이후 타임캡슐에 염원을 담아 각자 메시지를 적고 봉인하였는데요, 궁금하긴 하지만 2017년 연말에 공개될 터이니 소망이나 다짐한 각오들을 꼭 이루시길 기원하겠습니다.



다음 순서로 송년회 행사에 빠질 수 없는 선물교환의 시간!! 다들 센스 있는 선물과 덕담으로 분위기는 화기애애 그 자체였습니다. 개인적으로 가장 기억에 많이 남는 선물은 임천안 이사님이 준비하신 각종 마사지 기구였습니다.





송년회 행사를 참여하면서 많은 분과 대화를 할 수 있어 좋았고, 많은 정을 느낄 수 있었습니다.

그리고 2017년 1월 2일. 정유년 새해가 밝았습니다.
시무식은 이지현 주임님께서 사회를 봐주셨는데요, 서로 신년인사를 나누는 시간으로 화기애애하게 시작되었습니다.



시무식인 만큼 사장님께서 좋은 말씀과 더불어 지금의 人Co가 있기까지 애써주신 선배님들의 사진을 보여주셨습니다.



가장 기억에 남는 사장님 말씀은 원칙과 기준이었습니다. 어떻게 보면 제일 당연하면서 중요한 가치이지만 생각보다 지키기 힘들어 더욱 중요한 것 같습니다.
 
시무식 행사가 끝난 뒤 지난 일년 동안 월요세미나를 진행해 오신 Monday Trio 교체식이 있었습니다. 1기 선배님들 모두 고생 많으셨고, 2기 선배님들도 앞으로 잘 부탁 드립니다.
마지막 행사로 1월 생일자 분들을 위한 생일축하 행사와 케잌 컷팅식이 있었습니다. 권대건 선배님, 박원 선배님, 백영민 선배님 모두 모두 생일 축하드립니다.



올 한해 모두 건강하시고 건승하시길 바랍니다. 이상 Business Development팀 인턴 김성민이었습니다. 새해 복 많이 받으세요~~~

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(주)인실리코젠은 IT(Information Technology)를 기반으로 BT(Biological Technology)와 융합한 바이오 빅데이터 및 DB구축 전문기업입니다.

당사는 바이오 빅데이터 시장에서 SI 및 시스템개발을 통해 정보를 공유하고 소통할 수 있도록 플랫폼 등을 구축, 개발하고 있습니다.
또한, 바이오 시스템 개발분야의 전문 노하우를 통해 국내외 전문 기관들과 협력하여 Bio-informatics 분야의 선두주자로써 위치를 굳건히 하고 있습니다.
당사의 사업확장에 따른 전문인력 보강을 위해 관련 업무를 담당하실 인재를 모집하오니, 관심있는 분들의 많은 지원 바랍니다.

[상세모집요강]
1. 모집부문 : JAVA전문개발자(신입/경력)

2. 담당업무
1) 시스템 및 플랫폼 개발
2) 공공기관 SI사업 진행|

3. 자격요건
-신입-
1) JAVA/JSP 웹 시스템 개발 능력 보유자

(우대사항)
1) 전자정부프레임워크(eGOV) 경험자
  - Spring3.5 등 프레임워크 유 경험자
2) Oracle,/MySQL DB 연동 및 웹어플리케이션 개발역량 보유자
3) Bootstrap 등 CSS, HTML5에 대한 이해가능자
4) 관련학과 전공자 우대

-경력-
1) JAVA/JSP 웹 시스템 개발 관련 경력 3년 이상자
2) 전자정부프레임워크(eGOV)경험자
  - Spring3.5 등 프레임워크 유 경험자
3) Oracle,/MySQL DB 연동 및 웹어플리케이션 개발역량 보유자
4) Bootstrap 등 CSS, HTML5에 대한 이해가 높은 분

(우대사항)
1. 관련학과 전공자 우대

[전형절차]

※ 신입의 경우 서류전형 접수기간이라도 적합한 인재가 있을 경우 조기 면접이 진행 될 수 있습니다.

[채용형태]
- 신입 : 인턴직 0명(인턴 3개월 후 검증통과자에 한하여 정규직 전환)
- 경력 : 정규직 0명

[근무환경]
- 근무제 : 주 5일 근무
- 복리후생 : 4대보험, 퇴직연금 및 성과급
- 휴가제 : 연차, 경조사휴가, 장기근속자에 대한 충전휴가 및 유연근무제
- 지원 : 경조비 지원, 주차비 지원, 체력단련 지원, 야근시 석식 지원, 교육훈련 지원, 도서 지원

[접수기간 및 방법]
1) 서류전형 마감일 : 2017.01.23
2) 제출방법 : E-mail(보내시는 곳 : mst@insilicogen.com)

[제출서류]
1) 자사 입사지원서 : 파일명 `입사지원서_성명_개발.doc`으로 저장

입사지원서_성명_지원부문_2017.doc

2) 서류전형 합격자는 추가서류 제출
 ① 공통 : 포트폴리오(PPT) 제출 및 발표(자기소개 및 경력위주, 5분 이내)
 ② 신입
  - 개발 소스코드 예제(자신이 코딩한 부분중 가장 자신있는 부분을 발췌하여 1페이지 분량으로 제출)
  - 최종학교 성적증명서
3) 3차 서류제출(2차 임원면접 합격자에 한하여 개별통보)
 ① 공통 : 건강검진확인서 및 병력확인서 제출
 ② 경력
  - 전 근무지의 근로자원천징수영수증(퇴사연도, 직전연도)
  - 고용보험이력확인서
  - 경력증명서

[기타사항]
1) 기본예의 등 소양이 되어 있는 자(필수)
2) 해외 출장이나 개인 신용에 결격사유가 없는 자
3) 채용절차 진행 중 당사에 부합하는 지원자가 조기 채용 시 본 채용공고는 위 일정과 상관없이 종료될 수 있습니다.
4) 최종합격 후 입사지원서 및 제출서류 내용에 허위사실이 발견될 경우 채용이 취소될 수 있습니다.
5) 절차별 합격자는 E-mail을 통해 개별 안내해 드립니다.
6) 연봉 : 회사내규 및 경력에 따른 협의

[문의처]
- ㈜인실리코젠 채용담당자 / 031-278-0061(내선720번)
- E-mail을 통해 문의하여 주시기 바랍니다.(mst@insilicogen.com)

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<Fig 2. 흡연의_피해>

<Fig 3. 흡연으로_인한_유전자_변형>

<Fig 4. 흡연_시_변형될_수_있는_유전자_수>

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[입사지원서 양식]

人CoINTERNSHIP2017_지원서.doc

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들어가는 말

The Cancer Genome Atlas (TCGA)와 the Internal Cancer Genome Consortium (ICGC) 같은 대규모 암 유전체 연구 프로젝트를 통해 각기 다른 여러 기술적 플랫폼을 이용하여 다양한 형태의 데이터가 생산되고 있으며, 이러한 양질의 데이터를 자신의 연구에 활용하고자 하는 분들이 많을 것이라 생각한다. 그러나 전산적인 기술이 부족한 과학자들의 경우 유전체 데이터를 통합, 탐구, 분석하는 것이 쉽지 않은 일이다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여 국가 단위의 연구 프로젝트 결과를 연구자들이 쉽게 활용할 수 있도록 분석 도구나 결과를 요약해 놓은 웹 페이지가 생겨나고 있다. 그중 암 유전체 연구에 있어서 매우 유용한 정보 사이트가 cBioPortal이다. cBioPortal은 암 유전체 연구자들의 데이터 접근장벽을 낮추기 위해서 개발되었으며 이를 이용하면 암 유전체 데이터로부터 새로운 생물학적 통찰력, 치료, 임상시험에 대한 단서를 얻을 수 있다.

cBioPortal에 대하여

cBioPortal은 다양한 층위의 암 유전체 데이터를 탐색하고 분석하며, 그 결과를 가시적으로 확인할 수 있는 온라인 포탈 사이트다. 자세히 설명하자면, 암 조직이나 세포로부터 생산될 수 있는 유전체, 후성 유전체, 전사체, 단백질 발현체와 같은 다양한 형태의 데이터를 연구자들이 이해할 수 있도록 분석, 정리하여 그 결과를 제공하고 있다. 샘플과 유전자, 그리고 pathway 정보들에 따른 유전적 변화를 관찰할 수 있고 그 결과는 임상 정보와 연계되어 있다. 포탈에서 제공하는 기능을 보면 유전적 수준의 결과를 네트워크 및 생존 분석, 환자 중심 정보와 같은 다양한 플랫폼에서 여러 방법으로 가시화하여 제공한다. 이 글을 통해서 cBioPortal에 대한 소개 및 실질적인 활용방법을 설명하여 사용자들이 필요한 연구에 잘 활용할 수 있도록 도움을 주고자 한다.

cBioPortal은 각 유전자, 샘플, 그리고 데이터 타입에 따라 시각화 및 분석을 가능하게 하여 다차원적인 암 유전체의 탐색을 용이하게 한다. 이를 통해 사용자는 암 연구의 샘플에 따른 유전자 변형 패턴을 시각화할 수 있으며, 다양한 암 종의 연구 결과에서 유전자 변이 빈도(gene alteration frequency)를 비교할 수 있다. 그리고 포탈에서는 생물학적 pathway 탐색, 생존분석, 유전자 변이 간의 상호 연관성 분석, 선별적 데이터 다운로드, 프로그래밍적 접근이 가능하며, 논문에 발표할 수준의 잘 정리된 시각화 결과를 제공한다.

cBioPortal에는 체세포 변이(somatic mutation), 유전자 수 증폭 또는 소실(DNA copy-number alterations, CNAs), mRNA와 microRNA(miRNA) 발현, 유전자 메틸화(DNA methylation), 단백질 또는 인산단백질(phosphoprotein)의 양과 같은 형태의 데이터가 통합되어 있으며, 데이터는 Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) 같은 10개의 이미 논문화된 연구와 TCGA 파이프라인에서 현재 진행되고 있는 20개의 연구 결과가 포함되어 있다.

주요 검색기능 및 결과

cBioPortal에 있는 게놈 데이터는 웹 페이지에서 질의 또는 다운로드를 하거나 R이나 MATLAB과 같은 프로그램 패키지를 이용하여 접속할 수 있다. 사용자는 단일 연구 또는 여러 연구 결과에 대한 질의가 가능하고, 각각의 암 샘플에 관련된 유전적 변형도 확인해 볼 수 있다.

1. 질의 방법
cBioPortal의 첫 페이지를 보면 포탈에 있는 전체 암 종과 각 연구 프로젝트에 대한 정보가 트리 형태로 나와 있다(Fig 1). 사용자는 관심 있는 암의 종류와 암 종에 대한 각 연구 결과를 선택하고, 보고자 하는 유전자 정보(한 개 이상)를 넣고 검색을 실행한다. 연구를 선택할 때 단일 또는 여러 연구를 포함하여 질의가 가능하며 기존에 다른 사용자들이 정의한 유전자들(gene set)을 선택하여 진행할 수도 있다.

< Fig 1. 단일 연구 질의 실행방법 >

2. 질의 결과들
질의를 수행하고 나면 전체 결과의 요약 정보를 포함한 10개의 결과와 그 결과를 다운로드 받거나 즐겨찾기를 할 수 있는 정보들이 하위 메뉴 형태로 제공된다. 각각의 결과는 시각화되어 제공되고 직관적으로 수치적인 정보도 확인이 가능하다.

아래는 각각의 결과에 대한 정보이다.

2-1. OncoPrint
: OncoPrint는 각 실험정보에 대한 질의 유전자들의 변이 결과를 시각적으로 축약하여 표현한 결과이다(Fig 2). 각 유전자에 대한 변이정보, Copy Number Alteration(CNA), 유전자 또는 단백질 발현의 변화량을 색깔 별로 표현하여 보여주며 각 샘플에 대한 부가적인 정보는 블록에 마우스를 가져갔을 때, 확인할 수 있다.

2-2. Mutual Exclusivity
: 암의 생물학적 기능은 다른 유전자나 다양한 기능의 작용에 의하여 조절된다. 이런 상황에 대한 유전자 간의 관계 정보가 상호 배타성(Mutual Exclusivity)이고, 이와 반대되는 개념이 동시 발생(co-occurrence)이다. 즉, 한 유전자의 발현이나 변이가 다른 유전자의 발현을 억제하거나 증가시키는 현상을 나타낸다. 두 유전자 간의 관련성은 odd ratio (OR)로 계산하여 제공하며 결과에 대한 신뢰성은 Fisher’s exact test를 통해 표현되어 있다 (Fig 3).

< Fig 3. The Mutual Exclusivity tab >

2-3. Correlation Plots
: cBioPortal에서는 유전자의 변이나 증폭, 소실에 대한 결과뿐 아니라, mRNA, 단백질 발현량 또는 DNA methylation과 같은 결과 간의 관계도 시각화하여 보여주는데 correlation plot 결과가 이에 해당한다. 사용자의 선택에 따라 각 유전자에 대한 다른 데이터의 관련성을 다양한 그래프의 형태로 보여준다. 각 유전자의 발현 패턴과 질병과의 연관성을 확인할 수 있고, 여러 샘플 중 어느 샘플에서 유전적 변이가 발생했는지 찾을 수 있어 매우 유용하다(Fig 4). 그 결과는 그래프에서 마우스를 점에 갖다 대면 자세한 정보를 확인할 수 있다.

< Fig 4. The Plots tab >

2-4. Mutations
: 변이(Mutation) 결과에서는 각 유전자의 nonsynonymous 변이정보(아미노산 서열이 변경된 경우)를 볼 수 있는데, Pfam protein domain 정보를 토대로 모든 변이의 단백질에서의 위치와 종류, 변이가 일어난 샘플 정보 등을 확인할 수 있다(Fig 5).

< Fig 5. The Mutation tab >

2-5. Survival
: 암 유전체 연구에서 중요한 정보 중 하나가 변이 발생과 환자의 생존과의 연관성이며, 이것을 확인할 수 있는 방법이 생존율 분석(survival analysis)이다. 생존율 분석은 Kaplan-Meier 방법으로 계산하며, Disease-free survival은 더 이상 암이 진행되지 않는 환자를 대상으로 생존율을 계산한 결과이다(Fig 6).

< Fig 6. The Survival tab >

2-6. Network
: Network는 암에서 변이가 발생한 유전자들 간의 연관성을 network 형태로 보여주는 결과이다(Fig 7). Human Reference Protein Database (HPRD), Reactome, NCI, 그리고 Memorial Sloan-Kettering Center (MSKCC) Cancer Cell Map의 유전자간의 상호 연관성 정보를 가지고 network를 보여주며, 유전자의 변이가 많은 유전자일수록 붉은색으로 표현된다. 오른쪽 메뉴에서 선택하면 cancer와 연관되어 있거나 FDA에 승인을 받은 약물과의 연관성도 동시에 확인할 수 있다.

< Fig 7. The Network tab >

글을 마치며

유전자의 염기해독 기술이 급속도로 발전함에 따라 시간적, 비용적인 지출이 줄어들고 있으며, 이로 인해 기존에 진행되었던 암 유전체 연구의 스케일이나 결과가 매우 빠르게 증가하고 있다. 이와 더불어 암과 같은 질병은 한가지 요인보다 다양한 요인들에 의해 생겨나고, 그 원인을 찾고 치료하기 위해서는 다양한 형태의 데이터 분석을 통해서만 실마리를 찾을 수 있다는 것이 다수의 견해이다. 대단위의 암 유전체 데이터를 분석하려면 암에 대한 전공지식뿐만 아니라 전산적, 통계적 지식과 기술이 필수적이나 모든 연구자가 그러한 능력을 갖추는 것은 단시간 내에 불가능한 것이 사실이다. 그동안 나름대로 생물정보학적인 연구를 진행했었던 경험으로 볼 때, 자신의 연구분야에 대한 최신 정보를 습득하는 일도 쉽지 않은 상황에 기초부터 생물 정보학을 연마하는 것은 시간 낭비일 수 있다고 보며, 앞서 소개한 것처럼 관련 전문가들이 구축한 정보들을 우선하여 살펴보고 그 이후에 어떻게 자신의 연구와 연결할 것인지를 고민해보는 것이 현실적으로 현명한 판단이라 생각한다. cBioPortal 이외에도 많은 유용한 정보가 온라인에 공개되고 있으니 많은 연구자들이 잘 활용하여 좋은 연구 결과의 결실로 연결되기를 바란다.

• 참조 논문 Integrative Analysis of Complex Cancer Genomics and Clinical Profiles Using the cBioPortal

작성자 : Codes실 오태윤 책임컨설턴트 

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미국은 거대하고 다양한 볼거리가 많기에 평소 제 버킷리스트 중 하나였지만, 복귀 후 처리해야 할 업무를 생각하면 쉽지 않은 결정이었습니다. 특히 올랜도라는 지역은 2016년 성 소수자를 향한 총기 난사 사건이라는 좋지 않은 기억이 강하게 남아있었습니다.

어찌되었건 처음 무거웠던 마음을 내려놓으니 해외라는 기대와 설렘이 생겼고 학회참석을 위해 7월 7일 새벽 미국행 비행기에 올랐습니다. 군대 행군을 생각하면, 14시간 정도야 무어가 힘들겠냐는 섣부른 자신감과 그간 밀린 잠이나 실컷 자야겠다는 안일한 생각으로 시작된 비행은 2시간도 채 안 되어 저려오는 무릎과 쑤셔오는 허리, 끊어질 것 같은 목의 통증이 시작되었고 이동하는 동안 불만이 많았던 KTX의 편안함을 깨달을 수 있었습니다.

직항이 없는 까닭에 미국 댈러스에서 비행기를 갈아탔는데, 도착 당일 댈러스 백인 경찰을 향한 저격으로 흑백갈등 시위 및 집회의 소식은 저를 불안하게 했지만, 플로리다는 이래도 되나 싶을 정도로 조용하고 편안한 일상이 계속되고 있었습니다.

2003년 사스(SARS)로 전 세계가 공포에 떨고 있을 때 정작 당사자인 중국에선 별로 대수롭지 않게 생각하고 조용했던 것처럼 정작 본인은 괜찮은데 주변에서 너무 법석을 떤 것이 아닌가 생각이 들었습니다.

< 체크인 하고 받은 출입키와 안내서들 >

첫날 예약한 숙소는 학회가 열리는 스완&돌핀(Swan & Dolphin) 호텔에서 차로 20분 정도 떨어져 있는 힐튼 호텔이었습니다. 역시 관광도시라 그런지 숙소 주변은 온통 푸르고 깨끗하고 영화에서 봤던 모습 그대로여서 한국에 남아있는 걱정 따윈 순식간에 잊을 수 있었습니다. 여장을 풀고 가볍게 산책이나 하고 저녁이나 먹을까 싶어 숙소 근처에 있는 디즈니 스프링스라는 곳을 한 바퀴 휙 돌았는데 볼거리가 너무 많아 저녁 10시까지 걷는 강행군을 할 수밖에 없었습니다. 역시 디즈니 세상은 아이들의 꿈과 모험을 불러일으킬 수 있는 온갖 볼거리와 쇼핑거리를 선보여 주었고, 이를 보며 시종일관 고국에 두고 온 아들이 정말 좋아했을 텐데라며 아쉬워하는 한 아버지의 모습을 지켜보고 있자니 부성애가 무엇인지를 조금이나마 알 수 있었습니다. 유아용 미키마우스 면티를 하나씩 사 들고 숙소로 복귀한 후 48시간이나 되었던 길고 긴 첫날 하루를 마무리하였습니다.

< 만족스러운 크기의 공짜 커피 >

이튿날 숙박객에게 제공하는 공짜 커피 쿠폰으로 커다란 커피를 하나씩 들고 학회가 열리는 스완&돌핀 호텔로 이동했습니다.호텔에 도착한 후 간간이 돌아다니는 사람 중에 등 뒤에 포스터가 들어있을 것으로 추정되는 둥글고 기다란 통을 메고 어리둥절한 표정으로 어디로 가야할 지 고민하는 사람들이 보였기에 제대로 찾아왔다는 걸 재확인할 수 있었습니다. 학회 첫날이어서 그런지 학회 접수장은 예상과 달리 한산한 풍경이었고, 다소 의외였지만 줄도 안 서고 기다리지 않아도 되니 다행이란 생각이 들었습니다.

< 학회 참가 접수장 전경 >

접수를 마치고 누구나 그렇듯 학회 안내책자를 펼쳐 어떤 것들이 있나 확인하고 들을 만한 세션 선별을 위해 스케줄 표를 살펴보는데, 각 세션을 테마별로(Data, Disease, Genes, Systems 등) 친절하게 아이콘으로 표시되어 있어 동그라미 치는 데 상당히 도움이 되었습니다. 별거 아닌 거에 UX의 중요성을 느끼는 순간이었습니다. 학회 이름에 걸맞게 빅데이터나 가시화 같은 주제들이 적잖이 있어 상당한 기대감으로 일정을 잡았습니다.

< 메인 컨퍼런스 오프닝 행사장 >

학회 진행이나 프로그램은 이전 내용과 크게 달라지진 않은 것 같습니다. 학회 3일간의 일정은 하루가 시작되면 아침과 저녁으로 1시간씩 Keynote 발표를 하고, 5가지 형식(OP, WK, SS, TP, TT)으로 구성된 세션 발표가 있는데 TP(Technology Paper)의 경우는 각각 20분씩 진행됩니다. 세션 발표가 모두 끝나면 포스터 발표로 하루 일정이 마무리되는 형식이었습니다.

< 키노트 발표 모습 >

3일 동안 있었던 여섯 편의 키노트 발표는 각 분야에서 이름이 알려진 연사들이 최근의 이슈와 현재 진행 중인 연구들을 발표하여 참석자들의 많은 관심을 받았습니다. 암이나 단백질에 대한 심도 있는 연구보다는 생물정보 기술의 전반적인 소개와 최근 주목받는 머신러닝과 인공지능에 대한 컴퓨팅 알고리즘이나 질병 진단 자료를 이용한 텍스트마이닝을 통한 질병 관계 정보 확인 등에 관심이 갔고, 앞으로는 역학과 유전체가 함께 갈 수밖에 없지 않겠냔 생각이 들었습니다.

< 테마별 Technology Presentation >

테마별 세션발표는 주로 유전체와 단백질체에 대한 연구분야에서 알고리즘을 이용한 속도 향상과 대용량 데이터 처리를 위한 다양한 기술을 소개하고 있었습니다. 단백질 패스웨이 분석의 경우는 Spark 이용한 것도 있었고, PubMed와 GO 등 이미 생물정보 분야에선 기본이 되는 DB에 대한 텍스트마이닝 결과를 어떻게 효과적으로 통합해 유용한 결과를 만들어 낼 것인지에 대한 연구 결과도 보이고, 문헌데이터에 대한 생물정보 기반의 텍스트마이닝과 자연어처리 기술을 적용해 단백질 네트워크 분석 등에 적용된 사례를 보며 텍스트 역시도 데이터로서 충분한 가치가 있음을 확인할 수 있었습니다.

NGS 분석 및 네트워크 분석을 주제로 하는 것에선 효과적인 가시화 방법을 공유하고 싶었으나 안타깝게도 데이터베이스 구축에 관한 내용이 주가 되고 이렇게 표현되었다 정도의 설명뿐이라 다소 아쉽기도 했습니다. 가시화 부분은 아직까진 전산 엔지니어의 영역에 의지할 수밖에 없는 듯 합니다.

Deep Genomics란 곳에선 리암 니슨 닮은 분이 나와 그룹에서 진행하고 있는 Deep Binding 연구분야를 소개하고 앞으로의 비전을 제시하며, 생긴지 몇 년 안 된 그룹으로 현재 20여 명 정도로 앞으로도 생물정보 인력 충원을 위한 구인 중임을 어필했는데 불특정인을 대상으로 하는 구인광고 보다는 이렇게 직접 대상을 찾아와 함께하기를 권유하는 것이 더 효과적인 방법이지 않을까 싶고 학회를 어렵고 딱딱하게만 느끼는 저로선 처음 보는 모습이라 적잖이 신선해 보였습니다.

< Oral Presentation 을 위한 소회의장 >

첫날 Oral Presentation 세션은 어떻게 진행되는지 궁금해 주제와 상관없이 2명의 연사가 발표하는 것을 들었는데, 발표는 질문까지 포함해 5분 안팎으로 끝났던 것으로 기억합니다. 제가 들었던 것은 RNA 실험 및 분석 프로토콜에 관한 것으로 실험을 기반으로 하는 발표였기에 생물학 기본이 부족한 상태라 자료를 미리 보고 갈 필요가 있음을 느꼈습니다.

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그러다 보니 서버실의 더운 공기를 식히고 순환시켜주는 에어컨이나 공조장치들의 역할이 중요합니다. 보통은 에어컨에 적정온도를 맞춰 두고 24시간 가동하여 이런 문제를 대비하지만 언제나 그렇듯 사고는 예상치 못할 때 발생합니다.

의외로 이런 사고는 경험상 여름보다는 겨울이나 초여름에 잘 발생했습니다. 지난 겨울에는 실외기가 너무 추운 바깥 공기에 얼어붙어 버려서 냉매의 순환에 문제가 생겨 차가운 바람이 충분히 나오지 않는 문제가 생겼습니다. 그리고 보통 겨울에는 여름보다 조금 높은 온도를 에어컨에 설정해 두는데 갑자기 더위가 찾아오는 초여름에 너무 높아진 온도에 비해 충분히 차가운 바람을 내지 못하면서 서버실의 온도가 높아진 적도 있습니다.

이런 사고를 몇 번 겪었을 무렵 세상은 IoT(Internet on Things) 열풍이 불기 시작했습니다. 그중에서도 저의 관심을 끌었던 장비가 바로 라즈베리 파이(Raspberry Pi) 입니다. 라즈베리 파이는 영국 잉글랜드의 라즈베리 파이 재단이 학교와 개발도상국에서 기초 컴퓨터 과학의 교육을 증진시키기 위해 개발한 신용카드 크기의 싱글 보드 컴퓨터입니다. 크기는 작지만 하드디스크 대신 SD카드를 사용하고 HDMI 포트로 모니터와 연결도 가능하며 LAN포트도 있어서 인터넷 연결도 되는 엄연한 컴.퓨.터 입니다.

<스마트폰 보다 더 작은 컴퓨터, 라즈베리파이>

라즈베리 파이의 장점은 일반 USB 포트뿐만 아니라 다양한 통신 포트도 제공해서 여러가지 센서들도 제어할 수 있다는 점입니다. 예를 들어서 전기 신호를 켜고 끄도록 프로그램을 만들면 발광 다이오드에 불을 켤 수도 있고, 작은 모터를 동작 시킬 수도 있습니다. 초음파 센서나 감광센서를 이용하면 누군가 센서 앞을 지나가는 것을 알 수도 있습니다. 이젠 정말 좋은 아이디어가 있으면 누구나 직접 만들어 낼 수 있는 세상이 온 것입니다.

<다양한 센서를 조합하면 구현하지 못할 아이디어가 없다>

저는 이 라즈베리 파이에 몹시 흥미를 느꼈습니다. 그리고 이 작은 컴퓨터를 이용해 회사가 겪고 있는 어떤 문제를 해결하는데 사용하고 싶었습니다. 바로 우리 서버실을 높은 온도로부터 지켜줄 수 있는 장치를 만들고 싶었습니다.

저는 이 프로젝트의 이름을 Rainbow Guard Project 라고 이름을 지었습니다.

보통 서버들은 host name이라고 부르는 별명을 가지고 있습니다. 보통은 node0, node1, node2 이렇게 이름을 짓거나 소속 기관의 영어 약자로 붙여주곤 합니다. 디자인에 강한 우리 인실리코젠은 각 서버들의 성격에 맞는 색을 이름으로 지어 줬습니다.

• 강력한 파워를 자랑하는 분석 서버에게는 BLACK
• CPU가 많아 언제나 많은 분석량을 자랑하는 서버에게는 RED
• 많은 고객이 찾아오는 웹사이트를 운영하는 서버에는 GREEN
• 테스트를 많이 해서 정신이 오락가락한 서버에게는 PURPLE

Rainbow Guard Project 이렇게 다양한 색깔의 레인보우를 지켜주겠다는 의미를 지닙니다.

<애네들이 생각 나도 모른척 하세요, 아~재 소리 듣습니다...>

Rainbow Guard Project는 크게 3부분으로 나뉩니다.

1. 서버실의 온도를 체크하고 기록
2. 특정 온도 이상으로 온도가 올라갈 경우 서버실 관리자에게 경고 메일 발송
3. 24시간 동안의 서버실 온도 현황 조회

첫 번째 기능을 위해 먼저 라즈베리 파이와 온도센서를 연결하는 작업을 진행했습니다. 기왕이면 평상시 정상 작동 때와 온도가 높을 때를 구분할 수 있도록 LED도 있으면 좋겠네요. 이런 기능을 위한 회로도를 설계해 보고 납땜질도 하면서 깔끔하지는 않지만, 동작은 하는 온도 감시 및 알림 회로를 만들어 라즈베리 파이와 연결하였습니다. 저도 V=IR이라는 공식밖에 모르지만, 열심히 구글링하고 공부하면서 만들 수 있었습니다.

<PPT로 회로 설계도면을 만들고, 겨우겨우 납땜해서 만든 모듈>

리눅스에는 crontab 이라는 스케줄러가 있는데요, 온도센서의 값을 읽어와서 저장하는 프로그램을 만든 후 이 crontab의 스케줄에 추가해 주면 정기적으로 온도 감시가 진행됩니다. 덤으로 온도가 높아 졌을때 서버실 밖에 있는 사람들이 빨리 알아챌 수 있도록 음악이 나오게 셋팅해 뒀습니다. 경고 상태에서 나오는 음악은 f(x)의 'Dangerous' 입니다. 듣기만 해도 위험한 상태라는걸 알 수 있게 해줍니다.

<원래는 마이클잭슨의 Dangerous를 재생 시키려고 했는데 음원을 못 구해서...>

경고 상태가 되면 설정된 서버실 관리자들에게 다음과 같은 메일이 발송됩니다. SMS 문자를 보낼 수도 있지만, 유료 서비스라서 메일을 보내도록 설정해 뒀습니다. 어짜피 스마트 시대에 메일이 오든 문자가 오든 틈틈이 확인하는 습관이 있어서 상관은 없습니다.

마침 이 글을 작성하는 동안 경고 메일을 수신했습니다. 앞서 말씀드린 것처럼 봄, 가을 같은 환절기에는 에어컨의 적정온도가 변경되어 간혹 이런 경고가 발생하기도 합니다. 이번에는 날씨가 선선해 지면서 건물 중앙 관리 시스템이 적정온도를 조금 높이다 보니 서버실의 온도가 높아져 경고가 발생했습니다. 서버실 자체 에어컨의 온도를 조금 더 낮춰 해결하였습니다.

<토요일 새벽 6시에 경고 메일을 받은 서버관리자가 긴급 출동하여 초기에 대처>

 

경고 알림 메일에 있는 URL을 클릭하면 지난 24시간 동안의 온도 현황을 그래프와 함께 볼 수 있는 웹페이지로 이동하게 됩니다. 이 사이트는 Python Django를 이용하여 구현하였습니다. 제가 디자인 감각은 꽝이라서 정말 필요한 정보가 보이게끔만 만들어 봤습니다. 지금은 회사 동료들과 함께 조금씩 예쁘게 업그레이드하는 중입니다.

<저의 html 레벨은 15년 전에 멈춰 있습니다...

(그렇다고 배경에 보노보노를 넣고 싶진 않았어요 ㅠㅠ)>

이렇게 경고 알림 메일을 받으면 몇몇 직원들이 급히 서버실로 출동하여 상태를 점검하고 위기의 우리 서버들을 더위로부터 구출해 냅니다. 제가 납땜질이 서툴러서 회로의 한 부분이 끊어져 잠시 운영하지 못한적도 있지만 지금은 24시간 서버실에서 제 역할을 하고 있는 중입니다.

<일부러 서버실에서 더운 곳에 둬서 빨리 경고가 울리도록 설치>

 

위에서도 잠시 언급했지만 저는 주입식 교육을 통해 V=IR이라는 공식만 기억하는 동물세포 실험실 출신의 생물학 전공자입니다. 하지만 다양한 분야의 융합을 통하여 가치를 생성해 나가는 생물정보 분야의 동료들과 함께 일하면서 새로운 분야에 대한 도전 의지도 키울 수 있었던 것 같습니다. 잘 모르는 분야라도 꾸준히 보고, 듣고, 배우다 보니 생물학 너머 다양한 분야의 기술과 노하우를 배울 수 있었습니다. 그렇다고 아주 잘 하는 건 아닙니다. 생물 정보 분석을 위한 넓고 얕은 지식 정도 되겠네요. 여러분들도 생물정보 분석을 하면서 리눅스, 코딩, 통계 등의 난관에 부딪혀 많이 힘든 상황을 겪으실 것 같습니다. 하지만 포기하지 말고 꾸준히 밀고 나가다 보면 경계 너머의 다양한 즐거움을 느끼게 되실 거라고 믿습니다.  

 

<이미지 출처>

• IDC HOWTO - http://idchowto.com/?p=12787

• RayHightower.com - http://rayhightower.com/blog/2012/12/03/ruby-on-raspberry-pi/

• SUNFOUNDER - https://www.sunfounder.com/rpi2-sensorv2.html

• 후레쉬맨 - http://blog.daum.net/gkglh16/3

• f(x) - http://ppulset.tistory.com/552

작성자 : BS실 SP팀 심재영 선임 컨설턴트

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