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A Superior Solution for Microbial Genomics - 3

우리 몸을 구성하는 세포의 반 이상이 미생물 군집들로 차지하고 있습니다. 따라서 미생물의 분류학적, 유전적 기질은 사람, 동물 그리고 식물의 건강과 밀접한 관계를 가지고 있습니다.

특히 아직은 미생물의 유전적 기능 구성에 대한 정보가 구축되기에 어려움이 있고, 현재 metagenomics 분석 도구들도 기능적 구성이나 샘플간 변화 등을 정확하게 예측하기 위해 노력하고 있습니다. [Lindgreen et al. 2015].

만약 metagenome data를 de novo assemble 할 수 있고, 신뢰할 수 있는 기능 예측 결과를 통해 통계적으로 유의하게 변화된 것을 밝히는 분석도구가 있으면 어떨까요? 이러한 분석 도구가 NGS 데이터의 분석 표준이 되고 미생물 분석을 위해 최적화된다면 연구자분들에게 굉장한 도움을 줄 수 있을 것입니다.

미생물의 metagenomics 분석을 위한 플러그인인 CLC Microbial Genomics Module의 기능과 성능을 확인해 보세요.


결과 정확도

Figure 1. Metagenome 내 높은 정확도의 유전자 기능 예측 및 추적

2016년 1월에 Nature Scientific Reports에 14개의 다른 whole metagenome 분석 도구의 평가 결과에 대해 개재했습니다. 공개된 테스트 데이터를 이용해서metagenome의 기능적 분석이 가능한 5개를 선별하여 CLC Microbial Genomics Module과 비교했습니다. CLC Genomics Workbench에서 제공된 edge 테스트를 이용하여 통계적 분석을 진행하였고, photosynthesis, nitrogen fixation, pathogenesis에 대하여 분석을 진행하였습니다. (*는 통계학적으로 유의한, 정확한 변화를 일관적으로 예측하는 도구를 가리킵니다.)

Metagenomic 데이터를 바탕으로 미생물 군집에서 유전자 기능을 찾는 것은 어렵습니다. 더욱이 다른 metagenome 샘플간의 기능적 성질의 변화를 정확하게 측정하는 것은 더 어렵습니다. QIAGEN 솔루션은 미생물 유전체 분석에서 기능적인 차이를 정확히 찾고 정량화 할 수 있습니다. 또한 샘플간의 통계적으로 유의한 차이를 비교할 수 있도록 해줍니다.

여러 샘플의 비교는 샘플간의 기능적 변화를 찾고, 유사하거나 다른 기능적 요소를 분석하는데 쓰입니다.

Figure 2: 미생물 샘플들 전반에 걸친 기능적 비교

Metagenome에서 기능적 변화를 찾는 알고리즘은 많이 알려져 있지 않고, 기준이 되는 우수한 모델의 데이터셋이 없기 때문에 어려운 일입니다. 이런 어려움을 극복하기 위해 해당 연구결과에서는 기능을 파악하고 있는 두 합성 미생물 군집으로부터 각각 세개의 데이터셋(A1, A2, A3, B1, B2, B3)들을 만들었습니다.

Figure 2에서 보이는 것과 같이, CLC Microbial Genomics Module은 예측된 기능적 요소들의 비율을 바탕으로 두 개의 군집을 구분 할 수 있습니다.


Metagenome assembly 품질

새로운 Meatgenome assembler에서는 고품질의 어셈블리 결과를 생성하고 유전자 기능을 확인할 수 있습니다.

아래의 Table에서 CLC Microbial Module의 metagenome assembler와 다른 툴에서 misassembly, INDEL, mismatch error 등 다양한 지표들에서 어떤 차이가 나는지 비교해 줍니다.

Table 1 : Metagenome assembly의 품질 

QIAGEN metagenome assembler는 더욱 정확한 annotation을 가능하게 합니다. 데이터셋의 실제 길이는 209,845,413 base입니다.

 

실행 시간과 자원 효율성 계산

샘플의 크기가 크거나 데이터의 양이 많을때는 분석 실행시간과 요구되는 리소스가 매우 중요합니다.

테스트 데이터를 가지고 CLC Microbial Genomics Module의 어셈블러와 다른 어셈블러를 비교하였을 경우 분석 시간이 더 짧고 효과적이게 리소스를 이용하는 것을 확인하였습니다.

Figure 3. 최고의 metagenome assembly 분석도구


다른 metagenome 어셈블러들과 분석 시간과 리소스 사용면에서 비교하였을 때 우수한 결과를 보였습니다. (*MegaHit는 분석시간을 늘리면서 컴퓨터 메모리 소비를 줄이고 있습니다.)

 
분석에 소요하는 시간 축소


CLC Genomics Workbench 내의 workflow라는 기능을 이용하면 분석에 소요되는 시간과 노력을 크게 줄일 수 있습니다. 한번에 여러개의 데이터를 넣어줄 수도 있어 분석에 소요되는 시간과 동력을 절감시켜 줍니다.

Figure 4. 효율적인 workflow 기능


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(문의) Consulting팀 (대표전화 : 031-278-0061, 이메일 : consulting@insilicogen.com)

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2016/05/25 17:03 2016/05/25 17:03
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A Superior Solution for Microbial Genomics - 2


 
미생물의 유전체 정보를 알고 있다면 그 미생물을 어떻게 활용할 수 있을지 혹은 다른 strain 및 특징은 무엇인지 쉽게 확인 할 수 있습니다.
 
PacBio라는 NGS 플랫폼의 개발로 미생물의 de-novo 유전체 분석이 이전보다 더 활발해졌지만 기존에 활용하던 NGS 장비의 포맷과는 전혀 다른 raw 데이터 포맷(H5)을 지원하기 때문에 연구자들이 직접 분석하기 어려웠던 부분을 CLC Genome Finishing Module에서 수행할 수 있습니다.

Genome finishing에 있어서 short read들 만으로 contig 연결이 어려웠던 부분에 PacBio 데이터를 reference로 삼아 align이 가능하며, raw 데이터 수준의 PacBio 데이터의 error correction과 de novo assembly 기능이 추가되어 더욱 효율적으로 미생물 유전체 서열을 완성할 수 있습니다.

CLC Genome Finishing Module을 활용한 PacBio raw data의 error correction과의 de novo assembly의 성능 비교 테스트 결과는 아래와 같습니다.



HGAP과의 벤치마킹 자료를 바탕으로 CLC Genome Finishing Module은 laptop 환경에도 불구하고 running time과 메모리 활용이 훨씬 적은 것을 알 수 있습니다. 또한 모듈내에 함께 제공되는 워크플로우를 통해 더욱 연구자들이 쉽고 빠르게 분석할 수 있는 환경을 제공하고 있습니다.
 
현재 가지고 계신 데이터가 있으시다면, 한번 try 해보세요!


(문의) Consulting팀 (대표전화 : 031-278-0061, 이메일 : consulting@insilicogen.com)

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2016/05/18 15:35 2016/05/18 15:35
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우리들의 11번째 Culture Day 이야기

2016년 첫 Culture Day. 저희도 회사에서 맞는 첫 번째 Culture Day라 많이 설레었습니다.
이번 주제는 영화와 함께! 개봉한지 3일 째인 따끈따끈하고 가장 HOT한 캡틴아메리카 : 시빌워를 감상하였습니다.



화려한 액션과 긴장감 있는 스토리! 중간 중간 히어로들이 주는 웃음까지! 과연 누가 선이고 누가 더 선을 위해 행동하고 있는 걸까요? 그리고 마지막 쿠키영상이 2개나 있었다는데 우리는 1개 밖에 못 보고 나왔답니다.(엉엉)



영화가 끝난 후 인증샷을 찰칵! 그리고 회식장소로 이동하였습니다.
회식 메뉴는 맛있는 소고기!!

모든 분들이 참석하셨고 저희의 사회로 회식이 시작되었습니다. 사장님 말씀과 새로오신 주임님의 소개가 끝난 후 배불리 고기를 먹었습니다!

회식을 끝으로 공식적인 11번째 Culture Day가 끝이 났습니다. “人Co인”이 되어 처음 맞이하는 Culture Day! 아쉬움도 많았지만 즐거움이 더 많은 하루였습니다.


人CoTalk!

Culture Day가 끝난 후 셀프 인터뷰를 해보았습니다.

Q1) 처음으로 맞이한 Culture Day 어땠어요?

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회사에서 처음 준비하는 행사라 걱정이 많이 되었었는데, 많은 분들이 만족하신 것 같아서 기분이 좋았습니다. 이런 일을 하면서 항상 느끼는 점은 많은 사람들과 함께 무언가를 한다는 것이 참 즐거운 것 같습니다. 다음에는 대전지사 분들과 함께 할 수 있는 자리가 있었으면 좋겠다고 생각했습니다.




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인턴사원 입장에서 전 직원을 대상으로 한 행사준비에 있어 부담이 조금 있었습니다. 또한, 파견근무로 인해 물리적 거리 격차 때문에 준비를 하는 동기들에게 많은 도움을 주지 못해 미안했습니다. 영화표를 예매하는데 있어 50명 이상인 경우 단체예약 할인을 할수 있었는데 내년에는 직원 수가 더욱 늘어나 할인 혜택을 받았으면 합니다.




사용자 삽입 이미지
회사에서 처음 맞이하는 행사로써 많은 분들과 함께 할 수 있어 좋았습니다. 11번째를 맞이해서인지 모두가 일사불란하게 움직여 주셔서 순조롭게 진행이 잘 되었습니다. 무엇보다 부족한 점도 많았을텐데 따뜻한 격려와 칭찬 속에서 즐거운 시간을 보낸 것 같습니다. 앞으로 이와 같은 행사들이 종종 있다면 모든 사람들과 친해지고 업무도 서로 공유하면서 더 시너지 효과를 낼 수 있을 것이라고 생각했습니다.





Q2) 이번에 가장 신경썼던 부분이 무엇인가요?

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저는 식사 부분! 아무래도 회식은 맛있는 음식이 있어야 더 즐거운 법! 그래서 모두가 좋아할만한 메뉴를 선택하는데 신경을 썼습니다. 최종적으로 선택한 메뉴는 소고기였고, 많은 분들이 맛있게 드셨던 것 같습니다.




사용자 삽입 이미지
컬쳐데이의 주요 컨텐츠가 영화관람, 저녁(회식) 이였기 때문에 어떤 영화를 볼지 또한 회식장소는 어디를 할 것이며 회식 메뉴는 어떤 것을 정할지 고민이 많이 됐습니다.





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저희가 가장 먼저 고민했던 부분은 많은 인원이 함께 할 수 있는 자리, 주차 공간이었습니다. 다행히 많은 분들께서 잘 했다고 해주셨습니다. 그러나 단체 사진 공지 및 자유시간 공지 등 일부 미흡했던 부분도 있었습니다. 그 부분은 다음 기회에 더 멋지게 만들도록 해야겠습니다.






Q3) 컬쳐데이는 OOO 다.

사용자 삽입 이미지
컬쳐데이봄바람이다! 봄에 해서 그런 것도 있고, 지친 일상에서 벗어나 잠시동안 새로운 기운을 불어 넣어서 봄바람이라고 생각합니다.





사용자 삽입 이미지
컬쳐데이만남의 장소다. 컬쳐데이는 소통이다. 컬쳐데이는 인실리코젠의 문화다.





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컬쳐데이이다. ‘짬을 이용하지 못하는 사람은 항상 짬이 없다’라는 유럽 속담에서 알 수 있듯이, 아무리 바쁜 우리 일상생활 속에서도 즐거움을 찾고, 삶의 여유를 찾게 해준 좋은 시간이었습니다.





작성자 : DS그룹 박우진, BS실 박종인, BI그룹 서정한

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2016/05/13 16:31 2016/05/13 16:31
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A Superior Solution for Microbial Genomics - 1


미생물은 말 그대로 굉장히 작은 생물들이지만 환경과 생체에 미치는 영향력은 결코 작지 않으며, 미생물이 이 지구상에서 차지하는 비율 혹은 인체에서 차지하는 비율은 전체의 50%가 넘습니다. 다양한 환경에서 그 환경에 맞는 특정 미생물들이 살고 있고 이러한 미생물의 유전학적인 분석은 특정 유용 물질의 대량생산 하는 새로운 기술로서 개발하거나, 환경이나 질병 등에 대한 분석에 활용할 수 있습니다. 현재 다양한 NGS 플랫폼이 발달하면서 타 생물체보다 간단한 유전자 구조를 가지고 있는 미생물은 비교적 생물정보 분석도 용이하여, 전체 유전체 서열과 기능을 밝히거나 다양한 환경적 시료에서의 군집 분석을 많이 수행하고 있습니다.

1. Whole Genome 분석 솔루션



새로운 유전체의 서열을 조립하는 de novo assembly는 굉장히 복잡하고 어려운 일 중에 하나입니다. 하지만 PacBio 시퀀싱 플랫폼이 현재 굉장한 길이의 서열을 생산하면서 미생물 유전체 연구에 많이 활용되고 있습니다. Whole Genome 분석 솔루션은 다양한 NGS 플랫폼의 데이터의 GUI 형태의 de novo assembly 결과로부터 PacBio 데이터를 통한 scaffold 구축, 매뉴얼 gap filling 작업을 통한 미생물 유전체 서열을 확보할 수 있으며 ORF 예측 및 해당 서열의 blast, GO ontology 분석까지 가능하도록 패키지화 하였습니다.


2. Metagenome 분석 솔루션

미생물 군집을 분석하기 위해서는 16s rRNA 서열을 시퀀싱하거나 whole metagenome을 시퀀싱하여 진행합니다. Metagenome 분석을 위한 public tool들도 존재하지만 커맨드라인 기반으로 진행되기 때문에 일반 생물학자들이 사용하는데는 어려움이 많습니다. Metagenome 분석 솔루션은 NGS 플랫폼으로 시퀀싱한 데이터를 쉽게 분석할 수 있도록 미리 세팅되어진 워크플로우가 존재하여 OTU-clustering 및 diversity 분석 결과를 얻을 수 있습니다. 뿐만 아니라 whole metagenome 분석을 지원하여 de-novo assembly를 통한 contig 서열을 바탕으로 CDS와 gene을 예측하고 GO term 맵핑이나 BLAST를 수행하여 예측된 유전자 기능을 파악할 수 있습니다.


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(문의) Consulting팀 (대표전화 : 031-278-0061, 이메일 : consulting@insilicogen.com)

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2016/05/11 19:43 2016/05/11 19:43
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㈜인실리코젠은 지난 11년간 생물정보 전문기업으로 한 걸음 한 걸음 성장해 왔으며, 새로운 바이오 빅데이터 시대를 향해 한걸음 더 나아가고 있습니다. 또한 국내·외 다양한 기관들과 협력하여 생물정보 분야의 선두주자로써 위치를 굳건히 하고 있습니다.
당사의 사업 확장에 따른 전문 인력 보강을 위해 관련 업무를 담당하실 인재를 모집하오니, 관심있는 분들의 많은 지원 바랍니다.


1. 상세모집요강
[모집부문]

JAVA 개발자 (신입/경력)

[자격요건]
1) Oracle, Java, JSP, Servlet 개발 가능자

[우대사항]
1) 리눅스 기반 스크립트 프로그래밍 경험자
2) 전자정부프레임웍 기반 프로그래밍 경험자
3) 영어회화 가능자 우대

2. 전형절차 및 일정

1) 서류전형 : 2016.04.06 ~ 2016.04.20 / 제출서류 : 당사양식의 입사지원서
2) 1차 실무자면접 : 2016.04.25 ~ 2016.04.28 / 제출서류 : 자기소개 포트폴리오(PPT, 5분이내, 경력 및 보유기술, 자기소개 등)
3) 2차 임원면접 : 2016.05.02 ~ 2016.05.04 / 1차 실무자면접 합격자에 한하여 개별 통보
4) 추가서류 제출 : 2016.05.09 ~ 2016.05.13 / 채용 건강검진확인서(2차 임원면접 합격자에 한하여 개별통보)
5) 예정입사시기 : 2016.05.16(월)

3. 채용형태
1) 경력 : 정규직 0명
2) 신입 : 인턴직 0명(인턴 3개월 후 정규직 전환(검증통과자))

4. 근무환경

- 4대보험, 주 5일 근무, 퇴직연금 및 성과급, 야근 시 석식 제공, 경조사휴가 및 지원, 자기개발 지원, 주차비 지원, 체력단련 지원, 장기근속자에 대한 충전휴가 및 유연근무제

5. 접수기간 및 방법

- 마감일 : 2016년 4월 20일(수)
- 이력서양식 : 자사 입사지원서
- 접수방법 : e-메일접수(recruit@insilicogen.com)



6. 제출서류

1) 자사 입사지원서 : 파일명 `입사지원서_성명_지원분야.docx`으로 저장
2) 서류전형 합격자는 포트폴리오(PPT) 제출 및 발표(자기소개 및 경력위주, 5분 이내)

7. 기타사항
1) 기본예의 등 소양이 되어 있는 자(필수)
2) 해외 출장이나 개인 신용에 결격사유가 없는 자
3) 채용절차 진행 중 당사에 부합하는 지원자가 조기 채용 시 본 채용공고는 위 일정과 상관없이 종료될 수 있습니다.
4) 최종합격 후 입사지원서 및 제출서류 내용에 허위사실이 발견될 경우 채용이 취소될 수 있습니다.
5) 최종합격 후 원천징수영수증, 고용보험이력확인서, 경력증명서 제출(경력직)
6) 제출된 서류는 일체 반환하지 않습니다.
7) 절차별 합격자는 E-mail을 통해 개별 안내해 드립니다.
8) 연봉 : 회사내규 및 경력에 따른 협의

[문의처]
- ㈜인실리코젠 채용담당자
- E-mail을 통해 문의하여 주시기 바랍니다.(mst@insilicogen.com)

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2016/04/07 07:21 2016/04/07 07:21
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일정

일시 : 2016년 4월 20(수)~ 4월 22(금)

장소 : KT인재개발원 1연수관 302호

내용

유전체 데이터 분석과 질병연구에 대한 전반적인 이해와 분석 전략 및 실습

(자세한 프로그램 내용은 http://kobicedu.labkm.net 참고)



신청방법

신청기간 : 2016년 4월 6(수) ~ 2016년 4월 8(금)

선발인원 : 30

교육대상 :

  1) 유전체 데이터 분석과 질병 연구에 대한 이해와 분석 방법의 교육이 필요한 연구원 및 대학원생 등

  2) 모든 교육 일정에 참석이 가능한 교육생 (3일 일정 필수 참석)

선발안내 : 2016년 4월 8일(금) ~ 2016년 4월 11일(월)

교육비 : 무료 (중식 무료제공)

준비물 : 유무선 인터넷이 가능한 개인 노트북

신청방법

  - 온라인 신청 http://kobicedu.labkm.net

문의

  - ㈜인실리코젠 (031-278-0061, edu@insilicogen.com)

  - 문의게시판 이용 http://kobicedu.labkm.net/labboard/board/QnA



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2016/03/28 09:55 2016/03/28 09:55
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㈜인실리코젠은 지난 11년간 생물정보 전문기업으로 한 걸음 한 걸음 성장해 왔으며, 새로운 바이오 빅데이터 시대를 향해 한걸음 더 나아가고 있습니다. 또한 국내·외 다양한 기관들과 협력하여 생물정보 분야의 선두주자로써 위치를 굳건히 하고 있습니다.
당사의 사업 확장에 따른 전문 인력 보강을 위해 관련 업무를 담당하실 인재를 모집하오니, 관심있는 분들의 많은 지원 바랍니다.

1. 상세모집요강
[모집부문]

코딩 가능한 웹디자이너 / 웹퍼블리셔 / 프론트엔드개발자 (신입/경력)

[자격요건]
1) HTML, CSS (웹표준, 크로스브라우징) 가능자
2) 기본 디자인툴 활용 가능자

[우대사항]
1) 웹접근성 / 반응형웹 가능
2) javascript / jQuery 가능
3) 웹기획 또는 웹디자인 가능
4) 형상관리(GIT, SVN) 경험
5) 모바일웹 환경에서의 CSS3 모션 UI 구현 경험
6) 다양한 JavaScript Framework / Library (AngularJS, D3.JS, CytoscapeJS 등) 사용 또는 제작 경험
7) AJAX 서버연동 개발 경험
8) NODE.JS 등을 이용한 서버 사이드 기술 경험
9) Django / JSP 템플릿 이해
10) 사이트 운영 경험
11) 긍정적이며, 소통이 원활하신 분

2. 전형절차 및 일정
1) 서류전형 : 2016.03.23 ~ 2016.04.06 / 제출서류 : 당사양식의 입사지원서
2) 1차 실무자면접 : 2016.04.11 ~ 2016.04.15 / 제출서류 : 자기소개 포트폴리오(PPT, 5분이내, 경력 및 보유기술, 자기소개 등)
3) 2차 임원면접 : 2016.04.18 ~ 2016.04.19(1차 실무자면접 합격자에 한하여 개별 통보)
4) 추가서류 제출 : 채용 건강검진확인서(2차 임원면접 합격자에 한하여 개별통보)
5) 예정입사시기 : 2016.05.02(월)
※ 병역특례 지원자의 경우 1차 실무자면접 이후 2차 심화면접 진행함(총3차 면접)

3. 채용형태
- 경력 : 정규직 0
- 신입 : 인턴직 0(인턴 3개월 후 정규직 전환(검증통과자))

4. 근무환경
- 4
대보험
-
5일 근무
-
퇴직연금 및 성과급
- 야근 시 석식 제공

-
경조사휴가 및 지원
-
자기개발 지원
-
주차비 지원
-
체력단련 지원
- 장기근속자에 대한 충전휴가 및 유연근무제

5. 접수기간 및 방법
-
마감일 : 2016년 4월 6일()
-
이력서양식 : 자사 입사지원서
-
접수방법 : e-메일접수(recruit@insilicogen.com)

6. 제출서류
1) 자사 입사지원서 : 파일명 `입사지원서_성명_지원분야.docx`으로 저장
2)
서류전형 합격자는 포트폴리오(PPT) 제출 및 발표(자기소개 및 경력위주, 5분 이내)
3)
병역특례 지원자는 지도교수 추천서 필히 첨부


7. 기타사항
1) 기본예의 등 소양이 되어 있는 자(필수)
2) 해외 출장이나 개인 신용에 결격사유가 없는 자
3) 채용절차 진행 중 당사에 부합하는 지원자가 조기 채용 시 본 채용공고는 위 일정과 상관없이 종료될 수 있습니다.
4) 최종합격 후 입사지원서 및 제출서류 내용에 허위사실이 발견될 경우 채용이 취소될 수 있습니다.
5) 최종합격 후 원천징수영수증, 고용보험이력확인서, 경력증명서 제출(경력직)
6) 제출된 서류는 일체 반환하지 않습니다.
7) 절차별 합격자는 E-mail을 통해 개별 안내해 드립니다.
8) 연봉 : 회사내규 및 경력에 따른 협의

[문의처]
-
㈜인실리코젠 채용담당자
- E-mail
을 통해 문의하여 주시기 바랍니다.(mst@insilicogen.com)

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2016/03/23 17:15 2016/03/23 17:15
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2016 人Co INTERNSHIP 동계 프로그램 후기

순천향대학교 상민규

생물정보라는 것을 처음 접하게 된 계기는 학부생 때 전공수업인 생물정보학 수업을 통해서였습니다. 익히 알고 있던 실험을 통한 연구가 아닌 Bio와 Informatics라는 융합 학문이라는 것에서 흥미를 느끼고 관련 실험실인 생물정보학 실험실에 들어가 공부하게 되었습니다. 그렇게 공부를 하면서도, 생물정보학이 다른 분야에선 어떻게 이용되는지 모르고 정보를 분석하고 생산해내는 기술들에 대해선 자세히 몰랐습니다. 이러한 것들과 생물정보 기업에 대해 알아보고 경험해보고 싶어 알아보던 와중에 지도교수님께서 ㈜인실리코젠이라는 기업을 추천해주셨고, 이를 계기로 人Co INTERNSHIP 프로그램을 지원하게 되었습니다.
인턴십을 진행하는 동안 Planning팀, Consulting팀, 경영지원실 등의 많은 조직의 업무를 경험해 볼 수 있는 기회가 주어졌습니다. 여러 실무 경험을 쌓을 수 있는 좋은 기회가 되었고, 또한 생각지도 못한 여러 생물정보 분석 프로그램과 Linux, Python 등의 교육을 통해 자신의 능력을 향상시킬 수 있는 계기가 되었습니다. 처음 인턴십을 시작하면서부터 가장 크게 세운 목표가 linux에 대해 배우고 인턴이 끝날 때는 보다 능숙하게 다룰 수 있게 되는 것이었는데, 이번 프로그램을 통해 생물정보 분석 과정과 그 원리 등을 배울 수 있어 알찬 시간이었습니다. 이런 여러 실무 경험과 기본적인 교육, 그리고 분석을 할 수 있는 여러 프로그램 교육들이 앞으로 제가 나아갈 방향을 설정하고, 또 살아가는데 있어 많은 도움이 될 수 있다고 생각합니다.
무엇인가를 완전하게 배우고 몸에 익히기에는 짧은 시간이었지만, 여러 사람들을 만나고 사회 경험을 쌓으며, 저의 능력을 약간이나마 증진시킬 수 있는 소중한 시간이었습니다. 인턴십 기간 동안에 많은 도움을 주신 ㈜인실리코젠의 많은 선배님들과 이런 좋은 기회를 알려주신 지도교수님이신 이용석 교수님, 그리고 인턴십 기회를 주신 최남우 대표이사님께 깊은 감사를 드립니다.


순천향대학교 박종성

인턴십을 하기 전 홈페이지를 처음 접했을 때, 회사 소개에서 '人Co의 핵심가치는 사람을 중심(Core)으로, 사람과 컴퓨터(Computer)에 의해, 배려(Consideration)와 소통(Communication)을 통한 새로운 문화를 창조하는 것이다'라는 문구를 보고, 제가 평소에 추구하고 이상(理想)으로 생각하던, 인간중심의 회사라는 사실에 깊은 감동을 받았었습니다. 이러한 설레는 마음과 배움의 열망을 가지고 ㈜인실리코젠의 人Co INTERNSHIP 프로그램을 시작하게 되었습니다.

먼저 Wiki에 대해 처음 접해보았는데 이것은 제게 하루를 반성하고, 내일을 준비하는, 시간관리와 자기관리를 할 수 있는 기틀을 만들어 주었습니다. 처음에 인상 깊었던 것은 생물정보학 회사임에도 디자인 팀이 있는 것이었습니다. 그 이유가 회사 내부의 문화와 회사가 나아갈 방향을 알아야 그것이 디자인으로 표현되고, 회사의 상황에 따라서 즉각적인 반응을 할 수 있기 때문이라고 하셨습니다. 이것은 제 고정관념을 깨는 큰 가르침이 되었습니다. 또 '독서 경영'과 '집단 지성'을 중심으로 하는 人CoDOM 또한 굉장히 인상 깊고, 좋은 제도라는 생각이 들었습니다. Planning팀에서는, '이러한 기획이라는 일이 있어야, 지금까지 우리나라가 선진국들을 따라하고, 추격하면서 성장을 이루었던 것에서 벗어나서 진정으로 우리가 리드해 나가는 세상을 만들 수 있겠다'라는 생각을 할 수 있었고, Consulting팀에서는 Pathway Studio의 기본 사용자 메뉴얼을 제작하면서 기본적인 지식을 익히고, 이론 뿐만 아니라 샘플들을 분석해 실습도 같이 해볼 수 있어서 생물정보 분석에 관련하여 공부할 수 있는 좋은 기회였습니다. 또 인턴십 기간 중에 약 2주 동안에 걸쳐 DS 그룹에서 리눅스/파이썬 교육을 받고 실습을 해보면서, 분석에 기본이 되는 컴퓨터 언어들에 관하여 익히고, 활용 능력을 키울 수 있었습니다. 생물정보학을 접해볼 기회가 남들보다 많지 않았었기 때문에, 바로 이해하고 응용하는 것은 어려웠지만, 제가 스스로 공부하고 조금씩 응용하는 것을 익히며 큰 성취감을 느낄 수 있었습니다.
㈜인실리코젠이라는 기업을 겪어보면서, 사람중심의 기업운영, 人CoDOM, Descign 팀 등 정말 까도 까도 계속 벗겨지는 양파 같은 회사라는 생각이 들었습니다. 어쩌면 단순히 경력을 쌓기 위해서, 혹은 경험해보기 위해서 지원했던 이 인턴십은 새로운 분야를 경험하고 제 자신의 장점과 단점 및 새로운 가능성에 대해 확인할 수 있는 좋은 기회였습니다. 아직은 많이 부족하고 당장 남들보다 뛰어나기는 어렵겠지만, 남들보다 한 발 먼저 앞서 시작했다는 것은 분명한 것 같습니다. 항상 존중과 배려를 바탕으로 따뜻한 마음으로 대해주시고, 제게 방향을 제시해 주신 최남우 대표이사님을 비롯한 ㈜인실리코젠의 모든 人Co분들께 다시 한번 감사의 말씀을 드립니다.


부산대학교 박기림

㈜인실리코젠을 처음 알게 된 것은 2014년이었습니다. 당시에 학부 졸업을 앞두고 있던 저는 졸업논문을 작성하는데 있어 ‘CLC Main Workbench’ 라는 tool 을 접하게 되면서 생물정보학이라는 분야를 처음으로 알게 되었고 관심을 가지게 되었습니다. 2015년 대학원에 진학한 이 후 유전체 정보를 기반으로 한 원예작물 육종을 위한 분자마커 개발을 하게 되었습니다. 현재 연구하고 있는 주제는 다양한 수박 품종들의 전장유전체 재분석을 통하여 품종간 염기서열변이를 탐색하고 유전자 변이와 형질간 연관분석을 수행함으로 실제 분자마커 이용선발 육종에 필요한 정보를 얻는 것입니다. 연구를 진행함에 있어서 생물정보학의 기초부터 유전체 정보의 분석에 대하여 좀 더 자세히 공부하고 싶다는 생각이 들었습니다. 그 때 지도교수님의 추천으로 人Co INTERNSHIP 프로그램을 접하게 되었고 지원하여 좋은 기회로 약 4주간의 인턴 생활을 할 수 있게 되었습니다. 집이 부산이었기 때문에 한 달 간 회사 근처에서 방을 얻어 생활하게 되었습니다. 첫 출근날 많이 긴장했었는데 대표님께서 좋은 말씀을 많이 해주시고 선배들도 인사를 할 때 웃으면서 받아주시고 챙겨주셔서 감사했습니다. 1 주차에는 회사 생활에 대한 전반적인 교육을 들었습니다. 회사 소개와 사회 생활 등 다양하면서도 기본적인 교육을 듣게 되었습니다. 또한 생물정보 기초교육을 통하여 Linux와 python을 접할 수 있게 되었습니다. 2주차에는 전 주에 배웠던 기본 내용들을 바탕으로 하여 실제 생물정보학 문제를 풀어보는 시간을 가졌습니다. 기본 개념이 부족하다보니 다른 분들처럼 능숙하게 풀지는 못했지만 문제를 제 힘으로 풀었을 때 뿌듯함은 매우 컸습니다. 또한 CLC Genomics Workbench의 튜토리얼을 작성하며 Denovo assembly와 Re-sequencing 등 실제 데이터 분석을 배워볼 수 있었습니다. 첫 주에 미리 말씀을 해주셨던 자기소개발표 시간이 있었는데 많은 사람들 앞에서 제 소개를 하는 것이 익숙치 않아서 긴장을 많이 했었습니다. 발표 내용 중에 저의 장점과 단점을 정리하여 발표하였는데 간단한 슬라이드였지만 그 내용을 채우기 위해서 많이 생각을 할 시간을 가졌던 것 같습니다. 3주차에는 CLC 솔루션 교육을 참관할 수 있는 좋은 기회를 주셔서 튜토리얼 작성때 잘 풀리지 않았던 부분들을 직접 해보고 배울 수 있었습니다. 마지막 주에는 마무리를 할 수 있는 시간을 가졌습니다. 4주간의 人Co INTERNSHIP 과정을 통하여 한 모든 경험들이 제가 앞으로 나아갈 방향에 있어서 큰 도움이 될 것이라고 생각합니다. ㈜인실리코젠, 그리고 대표님을 비롯한 모든 직원 분들과의 좋은 인연에 감사드립니다.


상명대학교 남대근

인실리코젠과의 同行

저에게 인실리코젠이 처음 다가왔을 때는 15년도 말에 졸업하신 선배님들의 특강에서였습니다. 졸업을 하시고 사회로 나가는 첫 걸음인 첫 직장에 대한 두려움과 설렘을 사람이 중심인 기업, ‘Personalized Bioinformatics'라는 기치를 중시하는 기업인 인실리코젠을 통해 만족할 수 있었다는 말은 저에게 인실리코젠에 대한 궁금증과 알고자 하는 열망을 심어 주었습니다. 이렇게 인실리코젠은 저에게 다가왔고 저는 인실리코젠과 함께 하고 싶어 人Co INTERNSHIP 2016 동계 프로그램에 지원해 약 한 달 동안 인실리코젠과 동행할 수 있는 기회를 얻었습니다.
첫 주에는 회사소개와 인턴십 프로그램의 설명을 통해 좀 더 인실리코젠을 이해할 수 있었으며, 회사생활에 필요한 다양하고도 기초적인 교육을 받을 수 있는 시간을 가졌습니다. 뿐만 아니라 생물정보를 담고 있는 다양한 데이터를 다루기 위한 Linux와 Python을 교육받을 수 있었는데 이를 통해 저는 앞으로 나아갈 제 삶에 밝은 등불을 얻을 수 있었습니다.
둘째 주에 접어들었을 때는 지난 일주일간 받은 다양한 교육들을 활용할 수 있는 시간을 가졌습니다. Wiki를 활용하여 생물정보 분야의 집단 지성 창출을 목적으로 운영되는 지식 커뮤니티인 人CoDOM에 글을 올렸으며, Linux와 Python을 기초로 좀 더 심화된 생물정보관련 Rosalind 문제들을 풀고, CLC Genomics Workbench를 활용하여 De novo assembly와 BLAST 학습하며 데이터를 다루기 위한 능력을 높일 수 있었습니다.
삼주차 때는 지금까지 갈고 닦았던 프로그래밍 스킬을 통해 NGS 데이터들을 파싱하고 분석하는 시간을 가졌습니다. 다양한 NGS 데이터들의 format들을 다루어 정보를 밝히는 시간은 알지 못했던 방법을 익힐 수 있는 유익한 시간이었습니다.
마지막 주차는 마무리하는 시간을 가졌는데 그동안 학습하였던 것들을 정리하고 다잡을 수 있는 시간이었습니다.
인턴십 프로그램을 처음 접해보았지만 이렇게 알차게 시간을 보낼 수 있다는 것에 정말 감사하다고 생각합니다. 다양한 방법으로 Linux와 Python을 활용하여 데이터들을 다루고 이를 통해 정보를 밝히고자 하는 작업이 저에게는 처음해보는 일이었지만 앞으로 무엇이 필요하고 현재 무엇이 부족한지를 알 수 있었으며 사회 선배들과의 만남을 통해 그분들의 경험과 노하우를 알 수 있었습니다. 마지막으로 인실리코젠과의 동행을 함께 해준 모든 분들께 감사드립니다.


상명대학교 임수정


생물정보학이라는 컴퓨터와 생물학이 합쳐진 학문을 처음 접하고 나서 공부를 하다보니 더 배워보고 싶고 흥미도 생겨서 워크숍도 참석해보고 학교에서 공부도 열심히 하던 중 (주)인실리코젠이란 회사에 대해 처음 접했습니다. 정말 좋은 회사인것 같고, 가고 싶은 마음에 지원서도 써서 내보고 면접도 봐서 3:1의 경쟁률에서 뽑혔습니다. 출근하라는 메일을 받고 얼마나 기뻤는지 아직도 기억이 생생합니다. 첫 출근때 사회생활도 처음이고 학교에서만 지내다가 회사로 나오니까 뭘해야할지 몰라서 어리둥절했던 기억이 납니다.

집이 인천이었음에도 4주동안 한번도 지각을 한 적 없고 저 나름대로 부지런하게 지낸것같아 기분도 좋습니다. 회사를 4주간 다니면서 많은 업무를 하고 교육도 받았습니다. 공통교육을 통해 사회생활 예절과 기본적이지만 많은 도움이 되는 것을 배웠고 정말 만족스럽고 좋았던 교육이었습니다. 데이터분석에 쓰이는 CLC Genomics Workbench 실습 및 번역, 人CoDOM 작성 및 Linux, Python 등 전반적인 생물정보학 교육을 들었습니다. 또 회사선배님들과도 많은 이야기도 나눠보고 고민상담도 몇번 했었는데 정말 좋으신 말씀 많이 해주셨고 人Co의 가장 중요한 '사람관계'도 많이 배웠습니다.
길면 길고 짧으면 짧은 4주간의 인턴십을 통해 정말 많은 것을 배웠습니다. 생물정보학에 대한 기초와 심화된 내용, 회사에선 어떤 일을 하는지, 생물정보가 어떻게 이용되는지 등 많은 실무경험을 듣고 경험해보았고, 특히 사회생활에 대해 많이 배웠습니다. 4주 동안 제 자신의 부족한 점도 많이 찾게되었고 몰랐던 제 모습도 볼 수 있었고, 인턴분들과 같이 공부도 하고 일도 하고 재미있게 이야기도 많이 나누면서 더 친해진것 같아 사람관계의 중요성도 다시 한번 느끼게 되었습니다. 제 인생에 있어서 인턴십은 절대 잊지못할 추억이자 정말 좋은 경험으로 남을것 같습니다. 이러한 계기로 사회로 나가는 첫 걸음이 헛되지 않게 앞으로도 열심히 공부도 하며 노력할 것입니다.
마지막으로, 바쁘시지만 항상 웃으면서 대해주신 (주)인실리코젠의 최남우 대표님을 비롯한 모든분들께 감사의 말씀 전합니다. 人Co INTERNSHIP이란 프로그램을 통해 정말 많은 것을 배우고 경험하게 해주셔서 감사합니다.


Posted by 人Co

2016/02/18 16:20 2016/02/18 16:20
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일정

일시 : 20162월 22(월)~ 2월 24(수)

장소 : KT인재개발원 1연수관 207호


내용

미생물 유전체 분석에 대한 전반적인 이해와 분석 전략 및 실습

(자세한 프로그램 내용은 http://kobicedu.labkm.net 참고)



신청방법

신청기간 : 2016년 2월 3(수) ~ 2016년 2월 5(금)

선발인원 : 30

교육대상 :

  1) 미생물 유전체 분석에 대한 이해와 분석 방법의 교육이 필요한 연구원 및

     대학원생 등

  2) 모든 교육 일정에 참석이 가능한 교육생 (3일 일정 필수 참석)

선발안내 : 2016년 2월 11일(목) ~ 2016년 2월 12일(금)

교육비 : 무료 (중식 무료제공)

준비물 : 유무선 인터넷이 가능한 개인 노트북

신청방법

  - 온라인 신청 http://kobicedu.labkm.net

문의

  - ㈜인실리코젠 (031-278-0061, edu@insilicogen.com)

  - 문의게시판 이용 http://kobicedu.labkm.net/labboard/board/QnA

Posted by 人Co

2016/01/29 20:26 2016/01/29 20:26
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인실리코젠은 지난 10년간 생물정보 전문기업으로 한 걸음 한 걸음 성장해 왔으며, 새로운 바이오 빅데이터 시대를 향해 한걸음 더 나아가고 있습니다. 또한 국내·외 다양한 기관들과 협력하여 생물정보 분야의 선두주자로써 위치를 굳건히 하고 있습니다.
당사의 사업 확장에 따른 전문 인력 보강을 위해 관련 업무를 담당하실 인재를 모집하오니, 관심있는 분들의 많은 지원 바랍니다.

[상세모집요강]
병역특례 대상자 지원 가능(당사 전문연구요원 병역특례 지정업체임)
운전가능자(컨설턴트, 마케팅 부문) 필수
공통우대사항 : 영어회화 및 작문/독해 능통자 우대

[전형절차]

위 일정은 구인 진행상황에 따라 변경될 수 있습니다.

[채용형태]
- 경력 : 정규직 0
- 신입 : 인턴직 0(인턴 3개월 후 정규직 전환(검증통과자))

[근무환경]
- 4대보험
- 5일 근무
- 퇴직연금 및 성과급
- 야근 시 석식 제공
- 경조사휴가 및 지원
- 자기개발 지원
- 주차비 지원
- 체력단련 지원
- 장기근속자에 대한 충전휴가 및 유연근무제

[접수기간 및 방법]
- 마감일 : 201625()
- 이력서양식 : 자사 입사지원서
- 접수방법 : e-메일접수(recruit@insilicogen.com)

[제출서류]
1. 자사 입사지원서 : 파일명 `입사지원서_성명_지원분야.docx`으로 저장
2. 서류전형 합격자는 포트폴리오(PPT) 제출 및 발표(자기소개 및 경력위주, 5분 이내)



[
기타사항]
1. 기본예의 등 소양이 되어 있는 자(필수)
2. 해외 출장이나 개인 신용에 결격사유가 없는 자
3. 채용절차 진행 중 당사에 부합하는 지원자가 조기 채용 시 본 채용공고는 위 일정과 상관없이 종료될 수 있습니다.
4. 최종합격 후 입사지원서 및 제출서류 내용에 허위사실이 발견될 경우 채용이 취소될 수 있습니다.
5. 최종합격 후 원천징수영수증, 고용보험이력확인서, 경력증명서 제출(경력직)
6. 제출된 서류는 일체 반환하지 않습니다.
7. 절차별 합격자는 E-mail을 통해 개별 안내해 드립니다.
8. 연봉 : 회사내규 및 경력에 따른 협의

[문의처]
- 인실리코젠 채용담당자
- E-mail을 통해 문의하여 주시기 바랍니다.(mst@insilicogen.com)

 

Posted by 人Co

2016/01/26 17:11 2016/01/26 17:11
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