차세대 염기서열 분석 기술은 더 짧은 시간에 더 적은 비용으로 더 많은 염기서열을 결정할 수 있는 플랫폼이 계속적으로 업그레이드 되면서, 생물정보 분석은 이제 선택이 아닌 필수가 되었습니다. 또한 NGS 데이터의 분석 단계는 크게 pre-processing, assembly 그리고 assembly를 이용한 이차 분석으로 나누어 볼 수 있는데 이러한 분석 단계들을 하나의 툴에서 모두 진행하고 그 결과를 그래픽하게 확인할 수 있다면 NGS 데이터를 다루는 생물학자들이 훨씬 더 수월하게 연구를 진행할 수 있을 것입니다. 이를 위한 목적으로 개발된 CLC bio사의 CLC Genomics Workbench는 GUI 기반의 데스크탑 솔루션으로 각 NGS 플랫폼에서 제공하는 다양한 데이터셋을 지원하여 assembly를 비롯한 이후 이차분석까지 한번에 수행할 수 있는 통합형 생물정보 분석 도구입니다.

PART 1. Variant Detection

NGS 데이터를 이용한 최근 연구들을 살펴보면 resequencing 분석에 포커싱이 맞춰지고 있으며, 이러한 연구 동향에 발맞추어 CLC Genomics Workbench의 툴들도 resequencing 분석에 초점을 맞춘 SNP, Indel detection 툴이 업그레이드되었습니다.



Variant 분석에 대한 업그레이드 내용을 이야기하기 전에 read mapping 결과를 재조정할 수 있는 툴인 ‘Local realignment’를 먼저 소개합니다. 이전에는 beta 버전으로 제공되었지만 지난 달 업그레이드가 되면서 CLC Genomics Workbench의 정식 툴이 되었습니다. Read mapping을 수행하는 과정에서 align 되지 않았던 끝 부분을 realign하여 보다 정확한 read mapping 결과를 제공해줍니다. 자, 그럼 결과를 직접 눈으로 확인하는 것이 더 신뢰가 가겠죠?

위의 그림에서 [A]는 처음 read mapping을 수행했으며, 1,2,5번째 read의 4개의 염기가 제대로 align 되지 않아 gap이 생겨난 것을 확인할 수 있습니다. [B]는 [A]의 데이터를 가지고 ‘Local realignment’ 결과 화면을 보여주고 있습니다. [A]에서 gap이 발생했던 염기부분이 다시 realign된 것을 확인할 수가 있습니다. 이처럼 realign을 통해 정확한 mapping 데이터를 기반으로 이 후 variant 분석을 수행한다면 분명 고퀄리티의 결과를 얻을 수 있을 것입니다.

CLC Genomics Workbench에서의 SNP detection은 두 가지 알고리즘으로 분석을 수행할 수 있습니다. 하나는 확률을 계산하는 ‘Probabilistic Variant Detection’, 또 하나는 quality를 계산하는 ‘Quality-based Variant Detection’의 분석 툴입니다. 이러한 두 가지 분석 툴 중에 데이터의 특성에 적합한 것으로 선택하여 분석한다면 더욱 정확한 잠재적인 SNP를 발굴할 수 있습니다.

또한 새로운 버전에서는 SNP처럼 단일 염기가 아닌 더 넓은 범위의 영역에 대한 InDel(insertion, deletion)이나 structural variant를 detection 할 수 있는 ‘InDels and Structural Variants’ 툴이 추가되었습니다. 기존 beta 버전에서는 HiSeq 플랫폼의 paired read로 mapping된 데이터만 input으로 지원했던 부분이 Roche 454 플랫폼에서 생산되는 single read의 mapping 데이터도 input으로 지원되어 다양한 데이터셋의 hybrid assembly 결과도 indel 분석이 가능해졌습니다.

그리고 variant 분석 후 발굴된 SNP 후보들이 이미 알려진 variant 정보와 비교하여 필터링 할 수 있는 ‘Filter against known variants’와 이미 알려진 variant 정보를 추가할 수 있는 ‘Annotate from known variants’의 툴 기능도 향상되었습니다.

Read mapping을 통하여 분석된 variation들을 mapping된 서열 단위에서 그 결과를 뷰어할 수 있지만, track이라는 새로운 뷰어를 제공하여 브라우저 형태의 역할을 할 수 있도록 도와주고 있습니다. 이 또한 다양한 기능 업데이트를 통해 더 효율적으로 분석 결과를 확인할 수 있습니다.

이러한 track 툴을 활용하면 위에서 보는 바와 같이 한 종의 genome 내 다양한 정보들(Gene, CDS, Transcript, mRNA, Exon, Variation)을 한 화면에서 확인할 수 있고, 아래의 그림과 같이 Trio analysis 툴을 이용하여 부모에게서 자녀로 유전되는 SNPs 정보나 mutation 정보, 그로 인해 나타나는 질병 등에 대한 분석 후 그 정보를 한번에 확인할 수 있습니다.




PART 2. Workflow

앞서 이야기한 variation 분석은 만약 여러 샘플에 대한 분석을 개별적으로 진행하려면, 단순한 분석을 여러번 수행함으로 시간이 많이 소요됩니다. 이렇게 여러 샘플의 데이터를 각각 동일한 분석 과정을 수행해야할 경우, workflow라는 기능을 이용하면 빠른 시간안에 쉽게 분석을 완료할 수 있습니다. 아래의 그림과 같이 분석해야하는 툴(기능)들을 선택하고, 각 툴을 순서대로 나열한 다음 각 분석단계의 output 파일을 다음 분석과정의 input 데이터로 연결만 시키면 하나의 workflow가 만들어집니다.

이렇게 만들어진 workflow를 이용하여 분석하고자하는 샘플 데이터만 선택해주면 일련의 과정대로 클릭 몇 번 만으로 결과 데이터를 얻을 수 있으며, workflow를 installer로 변환하여 toolbox내에 하나의 툴로써 추가할 수 있어 실험실 내에서 정규화된 분석 파이프라인을 직접 제작할 수 있습니다. 그리고 이러한 workflow를 통해 만들어지는 output 데이터를 원하는 포맷의 파일로 별도의 export가 가능합니다.





PART 3. 3D Molecule Viewing

CLC Genomics Workbench 내에는 NGS 데이터를 분석하는 툴 외에도 일반 서열 데이터를 기준으로 분석할 수 있는 다양한 생물정보 툴들이 통합되어 있습니다. 이 중 Molecule Viewer는 Protein Data Bank(PDB) database에 저장되어 있는 단백질과 다른 분자들의 structure inspection과 visualization을 수행할 수 있도록 합니다. 이 전에는 CLC Genomics Workbench를 이용하면 단백질의 3D 구조의 뷰어만 확인할 수 있었습니다. 하지만 이번 업그레이드를 통하여 3D 구조의 뷰어뿐만 아니라 서열 정보와 연동되어 3D 구조상에서 선택된 영역이 어떤 서열로 이루어져 있는지 함께 뷰어가 가능해졌습니다. Domain 및 binding site 분석하시는 연구자분들이 늘 서열과 함께 분석되어졌음 좋겠다 하셨었는데, 이젠 굉장히 유용하게 사용될 수 있겠지요?

뿐만 아니라 Protein, Ligands, Water molecules, Internolecular bonds 등의 원하는 molecule 정보만을 선택하여 뷰어할 수도 있다고 합니다.





PART 4. Phylogenetic trees

이번에 소개해드릴 기능은 계통분석을 수행하는 실험실에서는 아주 반가운 소식이 아닐까 합니다. 사실 계통분석은 굉장히 어렵고도 다양한 알고리즘이 존재하여 현재는 전문적인 소프트웨어들을 많이 사용하고 있고, CLC Genomics Workbench를 통해서는 서열을 정렬한 후 기본적인 tree까지만 제공하며 분석 결과의 수정이 어려웠던 부분이 있었습니다. 허나 이번 업그레이드를 통하여 Phylogenetic tree module이 plug-in으로 새로 추가되어 좀 더 전문화되고, 분석 결과를 그래픽하게 확인할 수 있게 되었습니다.



Phylogenetic tree module은 Plug-in을 통하여 다운로드 받으신 후 ‘Create Tree’ 툴로 실행합니다. 실행 과정에서는 이전 버전과 달라진 부분은 없으며 뷰어 옵션을 지정할 수 있는 Side panel을 통해 tree 결과의 뷰어 설정을 변경할 수 있습니다.
Tree layout이 아래 그림과 같이 다섯가지로 선택할 수 있어 원하는 형태의 tree구조를 figure 자료로 사용할 수 있게 되었습니다.

또한 이 뿐만이 아니라 메타데이터의 수정도 가능해졌습니다. 이전 버전에서 이 기능을 문의하셨던 사용자분들도 굉장히 많았었는데요, 새 버전에서는 node, label 세팅 기능의 추가로 인해 사용자가 원하는 tree 그림을 그릴 수 있게 되었습니다.

이상으로 CLC Genomics Workbench 프로그램의 주요한 업그레이드 내용을 소개해드렸습니다. 블로그를 통해 모든 정보를 알려드리기가 어려워 아쉬운점이 있지만, 소개해드린 기능 이외에도 업그레이드 및 개선된 기능들이 많이 있으니 아래의 사이트를 방문하시면 더욱 자세한 정보를 확인할 수 있습니다.

http://www.clcbio.com/products/latest-improvements/

그리고 언제든지 생물정보 소프트웨어에 대하여 문의사항이 있으신 분들은
(주)인실리코젠의 마케팅팀(Marketing@insilicogen.com)을 찾아주시기 바랍니다!
감사합니다.

작성자 : Marketing팀 송하나

Posted by 人Co

제3기 人Co INTERNSHIP 수료생 이영호



첫째 날~ 수원의 날씨는 생각보다 좋았다. 해가 뜨진 않았지만 습하지 않고 시원한 바람이 불었던 걸로 기억난다. 마을버스(대구에는 없는)에서 시내버스로 환승하며 도착한 수원산업단지 그리고 (주)인실리코젠, 나의 인생에서 첫 번째 인턴십이 시작되던 날이다.
이번 인턴십 제3기의 총 인원은 나를 포함해 4명! 신기하게도 상명대학교 2명, 영남대학교 2명으로 초반부터 대립(?)되는 구도가 형성되었다고 선배님들께서 말씀하셨지만 이상하게도 우리들은 점점 더 가깝게 친해져서 회식도 하고 서로 도와주는 공생 관계로 4주를 함께 지냈다. 어쩌면 우리가 교육 받았던 생물정보 분석 프로그램들이 단합하지 않고 혼자 하기에는 너무 힘든 과정이었기에 서로 지식을 공유하면서 더 친해질 수 있지 않았을까 하는 생각도 든다.
CLC Main Workbench, CLC Genomic Workbench란 DNA, RNA, Protein 서열을 기반으로 여러 가지 정보를 얻어내고 그 정보를 통해 다양한 database를 구축하기 위한 생물정보 분석 프로그램이다. 내가 생각 했을 때 다양하게 분석된 생물정보 데이터는 database 구축을 통해 최종적으로 인간의 수명과 건강을 얻기 위함이 아닐까 싶다. 그런 의미에서 위의 2가지 프로그램들은 우리들이 원하는 목표의 밑거름이 될 수 있는 아주 좋은 도구가 될 것이다.
이런 도구들을 공부하는데 많은 도움을 주신 분들이 계시지만 특히 김경윤 주임님, 심재영 주임님, 송하나 선배님, 김경아 선배님들께 감사의 말씀을 전해드리고 싶다. 또 회사 생활에 대한 진심어린 충고와 조언을 아끼지 않고 해주신 임천안 이사님, 정은미 이사님 두분께도 너무나 감사드린다. 회사일 때문에 너무 바쁜 와중에도 우리 인턴들을 너무 잘 챙겨주시고 신경써주셔서 오히려 우리들이 모든 분들께 피해를 끼치는 게 아닌가 싶어 죄송할 때도 많았다. 조금 아쉬운 게 있었다면 나에 멘토이신 조아영 주임님의 분야는 디자인 쪽이셔서 교육내용에 대한 교류는 하지 못했지만 항상 친절하고 정답게 나를 챙겨주시고 좀 더 쉽게 회사에 적응 할 수 있도록 많은 도움을 주셨다. 마지막으로 (주)인실리코젠 최남우 대표님! 회사에 오기 전에 미리 홈페이지를 통해 사진을 보면서 느꼈었지만 외모도 너무 동안이시고 목소리도 다정다감 하셨다. 그래서인지 대표님과 첫 면담을 할 때 좀 더 편안하게 대화를 나눌 수 있었고 회사에 대한 믿음도 확고해졌다.
그렇게 1주차, 2주차 ,3주차, 4주차 시간이 지나면 지날수록 나 자신이 많이 변화하고 있다는 걸 스스로 느낄 수 있었다. 물론 짧은 인턴십 과정 중에서 배우게 되는 교육이나 회사 업무 등을 다 이해하고 습득하기에는 힘들 것이다. 하지만 난 이번 한 달 과정을 통해서 너무나 많은 경험을 할 수 있었던 것 같다. 첫째, 집을 나와 타지에서 자취하면서 생활하는 능력, 둘째, 규칙적인 식습관과 생활습관, 셋째, 직장에서의 예의범절과 대인관계, 넷째, 프리젠테이션 연습 등 평소에 경험하지 못했던 많은 것들을 여기서 배울 수 있게 되었다. 이 모든 경험들이 내가 앞으로 나아가야 할 방향에서 많은 힘이 될 것이라고 믿는다.
(주)인실리코젠, 그리고 대표님을 비롯한 모든 직원 분들과의 좋은 인연에 감사드립니다. 또 앞으로 더 좋은 인연이 되고 싶고 그렇게 될 수 있을 거라고 믿습니다. 감사드립니다.


제3기 人Co INTERNSHIP 수료생 윤선영



(주)인실리코젠의 人Co INTERNSHIP은 저에게 있어 사회 생활의 첫걸음이며, 한층 성장하는 계기가 되었습니다. 인턴십에 지원하기 위해 처음으로 자기소개서를 작성하고 면접을 보고, 직장 생활이 어떤 것인지도 알게 되었습니다. 조교로 계셨던 유승일 선배님이 석사 졸업후 취직했다는 소식과 함께, 그 회사에서 인턴십 프로그램을 진행한다는 교수님의 소개로 인해 (주)인실리코젠이라는 회사를 처음 접하게 됬습니다. 어떤 일을 하는 회사인지 알고 싶어 먼저 홈페이지를 찾아보게 되었는데, 깔끔한 페이지 구성과 블로그를 통해 회사소식에 대한 여러 내용들을 볼 수 있었습니다. 또한 설립된 지 얼마되지는 않았지만 연혁으로 미루어 봤을 때, 비약적인 발전을 하고 있는 회사라는 점도 눈에 띄였습니다. ‘한 번쯤 이런 회사에서 실무적인 것을 경험하고 배운다면 내 인생에 있어 많은 것이 도움이 되겠구나’ 생각이 들어 망설임 없이 지원했던 기억이 납니다.
일산에서 수원까지 많이 먼 거리는 아니지만 출근시간도 빠르고, 처음으로 하는 사회생활인 만큼 열심히 해보고자 수원역 근처에 방을 얻어 한달 동안의 인턴 생활을 시작하게 되었습니다. 입사 첫 날 가장 먼저 모든 분들께 인사를 드리며 명함을 받았는데, ‘단순히 인턴이라 생각하고 지나칠 수 있었던 부분인데 역시 인실리코젠에서는 사람 사이의 관계를 소중히 생각하는구나’ 라고 느꼈습니다. 한달이라는 짧은 기간 동안 인실리코젠의 人Co 가치체계에 걸맞게 사람을 중요시하는 회사라는 점을 확실히 느꼈습니다.
첫 주에는 회사소개와 사회 생활을 어떻게 해야 하는지에 대한 기본적인 교육을 받았습니다. 면접을 보기 전에 미리 홈페이지를 통해 간략하게 보았던 내용에 대해서 자세한 설명을 들으니, 훨씬 이해도 잘 되었고 무슨 일을 하는 회사인지에 대해 확실하게 알게 되었습니다. 또 사회 초년생에게 필요한 조언과 충고를 해주신 임천안 이사님과 직장 생활에서 꼭 필요한 예절을 가르쳐주신 정은미 이사님의 말씀이 아직도 기억에 납니다. 면접을 볼 당시에도 그리고 한 달동안 저희를 대할 때 항상 웃음을 잃지 않으셨던 정은미 이사님의 모습을 본받아야겠다고 생각했습니다.
일주일 뒤 수요세미나에서 자기소개 발표 시간이 있었는데, 어떻게 하면 지루하지 않은 발표를 할까 고민을 믾이 했었습니다. 첫 발표라 긴장도 많이 되었지만 다행히도 재미있게 들어주셔서 발표하는 동안 떨지 않고 무사히 마무리 할 수 있었습니다. 둘째주와 셋째주는 생물정보 통합 분석 소프트웨어인 CLC Main Workbench와 CLC Genomic Workbench를 통하여 생물정보의 기초에 대해 배웠습니다. 갈수록 어려워지는 내용을 배울 때마다 좌절하는 순간이 왔지만, 그럴수록 저희를 위해 열심히 교육해주시는 분들 때문에 더욱 힘이 났습니다.
인턴십을 시작한지도 벌써 한 달이 다되어갑니다. 인턴십 프로그램에 참가하여 저의 부족한 점이 무엇인지 깨달을 수 있었고, 이런 깨달음을 통해 앞으로 채워나가야 할 점들을 확실히 알았습니다. 어떻게 보면 비록 한 달이라는 짧은 시간 동안 이론과 생물정보분야에 대해 많은 내용을 배우고 가지는 못하지만 사람을 대하는 방법과 사회 생활을 어떻게 해야 하는지에 대해서는 확실히 배우고 가는 것 같습니다. 그리고 한 달동안 같이 공부했던 인턴십 3기 분들과 저희에게 좋은 말씀을 해주시고 이끌어주셨던 (주)인실리코젠의 모든 분들 잊지 못할 것 같습니다. 마지막으로 이런 인턴십 프로그램을 계획하시고 좋은 경험을 할 수 있게 해주셔서 감사합니다.


제3기 人Co INTERNSHIP 수료생 이수민



안녕하세요. 人Co INTERNSHIP 프로그램에 참여한 이수민입니다. 교수님의 추천과 학교의 현장학습 제도를 통해서 (주)인실리코젠의 人Co INTERNSHIP 프로그램을 시작하게 되었습니다. 선배님이 보내 주신 자료와 교수님의 설명을 통해 처음으로 Bioinformatics 분야에 대해서 알게 되었고 가서 한 달 동안 생물정보에 대해 열심히 배우고 막연한 두려움만 가지고 있던 사회생활을 경험하여 성장해서 돌아오겠다고 다짐하였습니다. 그렇게 기대 반, 두려움 반으로 대구에서 수원에 오게 되었습니다. 첫 출근 낯선 출근길, 장소, 사람들, 모든 것이 낯설게 느껴졌습니다. 사실 회사에 오기 전 회사 홈페이지에서 '사람을 중시 한다는 가치' 가 너무 마음에 들었습니다. 아니나 다를까 역시 회사 직원분들 모두 친절하게 대해 주시고 회사 분위기도 제가 평소에 생각해오던 분위기와 다르게 화목했습니다. 그리고 떨렸던 면담시간에 대표이사님께서 저희를 편하게 해주시고 부담감을 줄일 수 있게 해주셔서 그런지 이런 좋은 환경 속에 점차 길도 익숙해지고 금방 적응할 수 있었던 것 같습니다. 그리고 첫주 위키, OJT, 사회생활의 예절 등 익숙하지 않은 것을 접하고 배우게 되었습니다. 또한 사원의 마음가짐이라는 책을 읽게 되었습니다. 사실 저는 지금 배우고 있는 생물정보 분석 툴도 중요하지만 이 첫 주에 읽은 책과 교육도 정말 중요하다고 생각합니다. 저는 책을 읽고 독후감을 쓰면서 제가 잘못 생각하고 있던 마음가짐을 배우게 되었고 정은미 이사님과 임천안 이사님의 사회생활 교육으로 제가 잘못하고 있던, 어쩌면 처음 사회생활을 했다면 독이 되었을 부분을 알게 되었습니다. 아마 사회의 초심자인 인턴에게는 정말 중요한 첫 주 였다고 생각합니다.
두번째 주 - 이제 본격적으로 CLC Main Workbench 프로그램을 통해 생물정보의 기초를 다루고 저희를 회사 모든 분들에게 알리는 자기소개를 준비하게 되었습니다. 나름 창의적이게 하고 싶어서 열심히 준비 하였습니다. 발표 전 이제 다소 지루 할 수 있는 가장 부담되는 마지막 순서였습니다. 그리고 15분 준비했는데 아침에 7분안에 해야된다는 충격적인 소식을 들었습니다. 일단 발표를 하였고 나름 카카오톡 이미지로 신선하게 다가가 처음은 괜찮게 시작하였다고 생각했습니다. 하지만 7분으로 줄이기는 너무 힘들었고 제가 정말 하고 싶었던 저의 가치관 등을 거의 생략하게 되어 아쉬웠지만 여러 사람들 앞에서 발표하고 준비하고 정말 좋은 기회였다고 생각합니다. 그래 두번째주, 세번째주를 걸쳐 배운 CLC Main Workbench 프로그램을 통한 생물정보 분석은 처음에 너무 낯설었고 '과연 내가 해낼 수 있을까'라는 부담이 있었습니다. 하지만 송하나 선배님, 김경윤 주임님, 김경아 선배님에 둘러 쌓인 자리라서 엄청 바쁘신 것을 앉아만 있어도 느낄 수 있었습니다. 그런 와중에도 질문하면 친절하게 잘 설명해주신 덕분에 조금 익숙해지고 압박감에서 벗어 날 수 있었습니다. 정말 감사합니다. 그리고 배우면 배울수록 프로그램이 정말 대단하고 바이오 산업이 급속히 발전 하기위해 꼭 필요한 프로그램이라는 것을 알았습니다. 그리고 매주 금요일 프리젠테이션은 미뤄지기도 했지만 파워포인트 작성 능력과 발표 능력을 키울 수 있는 좋은 기회였습니다. 다른 분야에 가서도 꼭 필요한 교육이라 생각됩니다.
이제 기본기를 다진 후 중요한 CLC Genomics Workbench 프로그램을 접하게 되었습니다. NGS 포맷을 지원해서 NGS 데이터들을 통합적으로 분석하는 프로그램인 CLC Genomics Workbench가 지금 이 생물정보 분야에 중요한 저희에게는 잠깐이나마 이 분야을 조금 경험 할 수 있는 기회였습니다. 이 주에는 김경윤 주임님이 내 주신 과제로 저희가 실제로 무언가 분석을 해볼 수 있다는 것이 흥미롭고 좋았습니다. 물론 제가 원하는 결과는 얻지 못하였지만 이 분야에 매력을 느낄 수 있는 좋은 기회였습니다.
저는 분명 이 한 달이 자기소개에서 발표 한 것처럼 제 인생에 정말 중요한 퍼즐 조각이 될 것이라 확신 합니다. 회사에 대한 저의 마음가짐과 잘못된 습관을 고칠 수 있는 계기가 되었고 생물정보학에 대한 눈을 키우게 되었습니다. 한 달동안 저희 4명이 부족해도 이해해 주시고 친절하게 대해주시고 웃어주신 모든분들께 정말 감사합니다. 한 달이 정말 짧은 기간이었던 것 같습니다. 처음 멘토분들과 점심을 먹은 것이 어제 같은데 벌써 한달이 지나가고 이렇게 후기를 쓰게 되었습니다. 이러한 도움이 헛되지 않게 앞으로 이 마음가짐을 잃지 않고 이 한 달의 기억을 잊지 않겠습니다. 마지막으로 한번 더 모든 (주)인실리코젠 직원분들게 감사하다는 말과 함께 후기을 끝내도록 하겠습니다. 모두들 정말 감사 합니다.


제3기 人Co INTERNSHIP 수료생 이용은



학교 수업 중 지도교수님께서 (주)인실리코젠에서 진행하는 人Co INTERNSHIP에 대해 설명 하시고, 참가 희망자를 말하실 때 첫 번째로 손을 들었던 기억이 납니다. 졸업한 몇몇의 선배님들이 다니고 있고, 생물정보를 하는 회사라는 정도만 알고 있었는데, 회사 홈페이지와 블로그를 보면서 사람을 중심으로 하는 고객 맞춤형 서비스업을 중요시 하는걸 알았습니다. 직접적으로 이력서를 작성 하는 것이 처음이라 어떤 내용을 적을까 고민도 해보고 면접을 볼때 어떤 복장과 어떤 말을 해야 좋을까라는 생각을 했었습니다. 시간이 흘러 저에게 전화 한통이 왔는데, 그것은 바로 (주)인실리코젠에서 걸려온 전화였습니다. 서류가 통과 되었으니 면접을 보러오라는 전화였습니다. 면접 당일 파주에서 새벽 기차를 타고 낯선 수원까지 와서 첫 면접을 보려고 하니 매우 긴장되었지만, 입구 게시판에 welcome이라는 글귀 아래 제 이름이 적혀 있는 것을 보고 괜시리 뿌듯했었습니다. 긴장되었지만 면접에서 당당히 준비했던 말들을 모두 하고 만족스런 면접이 그렇게 끝이 났습니다. 최종결과가 있던 날!! 아침 일찍 부터 합격 통보 전화를 기다리고 또 기다리던 찰나에 전화가 걸려왔는데 인턴십 프로그램에 합격 했으니 7월 4일부터 출근 하라는 전화였습니다. 가벼운 발걸음으로 첫 출근을 하던 날 모든 직원 분들께 인사를 드리고 명함을 받았는데 바쁘신 중에도 웃으면서 인사를 받아주시던 (주)인실리코젠의 모든 분들이 아직도 생생히 기억납니다.
1주차에는 사회생활에 필요한 예절교육과, 안전교육, wiki 사용법 등 교육을 받았고, 2주차 수요세미나 시간에 자기소개 발표가 있으니 준비하라는 얘길 들었습니다. 어떻게 준비해야 나란 사람을 소개할까 생각하면서 발표 준비를 하였고, 드디어 첫 발표를 하던 날 (주)인실리코젠의 모든 직원 분들이 보는 앞에서 발표를 했습니다. 며칠간 발표 연습을 했지만 학교와 다른 분위기에서 첫 발표를 한다는 생각에 떨었습니다. 특히 슬라이드 마지막에 제 이름을 기억해 달라고 했었는데 지금 생각해보면 닭살 돋고 손발이 오글거리는 멘트였습니다.
그리고 2주, 3주차에는 본격적으로 분자생물학 데이터 분석 및 관리를 위한 통합 생물정보 분석 툴인 CLC Main Workbench와 NGS 데이터 분석이 가능한 CLC Genomics Workbench에 대해 배웠습니다. 매주 금요일은 한 주 동안 공부한 것을 파워포인트로 제작하여 발표 했었는데 저에게 자신감도 길러주었고, 다시 한 번 복습 할 수 있는 좋은 시간이었습니다. 어느덧 4주차가 되어 人Co INTERNSHIP이 끝나게 되었지만, 4주 동안의 생활은 앞으로의 생활에 큰 도움이 되었습니다. 평소 아침 잠이 많은 저를 부지런하게 만들어 주었고, 사원의 마음가짐이란 좋은 책을 읽을 수 있는 기회와 여러 교육들을 들으면서 사회생활에서 필요한 예절 및 행동들을 배울 수 있었습니다.
4주의 짧은 시간이었지만 저에게 좋은 말들과 도움을 주셨던 멘토 심재영 주임님을 비롯한 모든 분들에게 감사드리고, 이러한 좋은 추억과 인연을 만들어 주신 최남우 대표님께 감사하단 말 전해드리고 싶습니다.

Posted by 人Co

6월 5일 인실리코젠의 첫 체육대회 人Co PLAY가 열렸습니다.
본사, R&D Center, 대전지사 각지에서 고생하고 계시는 분들과 함께 단합을 도모하고, 광합성도 하고자 체육대회를 기획하게 되었습니다.
비소식이 있어 행사 전날까지 걱정을 했지만 걱정과는 다르게 뜨거운 햇빛이 쨍쨍 내리쬐고 있었습니다. MC9(자칭 MC나인이라 소개하신 구세완 선임님^^)의 깨알같은 진행으로 시작된 체육대회는 첫째도 안전, 둘째도 안전이기에 멋진 진행요원들의 동작을 보며 국민체조로 힘차게 시작하였습니다.
 


경기가 시작되었습니다! 네 팀으로 나누고 각 팀의 구분은 손수건으로 하였습니다.
파란색, 하늘색, 녹색, 연두색!



첫 번째 경기는 날아라 운동화.
몸풀기 경기임에도 불구하고 모두들 열정적으로 하셨습니다. 과연 누가 더 멀리 더 정확하게 던졌을까요?



첫 번째 경기가 끝나고 다음은 단체 제기차기가 있었습니다.
모든 조원들이 한번 이상씩 돌아가며 제기를 떨어뜨리지 않고 빠른 시간내에 차면 승리하는 게임인데요, 여직원 분들에겐 쉽지 않은 게임이었던 반면 남직원 분들은 역시 제기왕!
특히 임천안 이사님의 뛰어난 운동 신경으로 2조가 우승을 거머쥐었습니다.(짝짝짝!)



그 다음은 연결 그림 그리기와 이심전심 퀴즈!
마치 골든벨을 연상시키는 게임으로 각 조의 센스와 그림 실력을 볼 수 있는 시간이었습니다.



이후 2인 3각 달리기를 열정적으로 마친 후 오전 경기 클라이막스인 단체 줄넘기가 있었습니다. 호흡+순발력+체력이 뒷받침 되어야 이길 수 있는 게임으로 처음에는 다들 머뭇거렸지만 점점 승부욕에 불타올랐습니다. 점수를 계속 역전시키다가 결국엔 최강 2조가 엄청난 격차를 벌이며 우승하였습니다.



갑작스런 점프와 체력 소진으로 기직맥진 한 것도 잠시, 맛있는 도시락이 기다리고 있었는데요 운동 후에 먹는 도시락이라서 그런지 정말 꿀맛이었습니다.^^
예쁜 경아씨의 도시락 먹기 전 미소~



점심을 맛있게 먹은 후 인실리코젠의 예쁜 여직원들과 이번 단합대회 준비해주신 분들의 멋진 사진도 찍으며 잠시나마 휴식의 시간을 가졌습니다.


오후 경기는 볼링경기였습니다. 한적했던 볼링장을 우리 人Co인들의 그린, 블루로 가득 메웠습니다. 다들 숨겨두었던 실력들을 보여주셨는데요, 노승재 팀장님께서 최고점인 220점이나 나오셨네요! 이부장님께서는 너무 열심히 해주신 나머지 부상투혼을 보여주셨습니다.



마지막까지 어떤 조가 승리할지 점수를 합산하며 두근거리는 순간이었습니다.
우수점수자들에게 상품권도 증정되고 뜨거웠던 볼링대회를 마무리하며 단체사진 찰칵!



모든 경기를 마치고 함께 맛있는 오리고기를 먹으러 갔습니다.
경기 시작 전부터 끝까지 누구보다 열정적으로 참여해 주신 사장님! 1등 조장님에게 상품도 전달해 주시면서 좋은 말씀도 해주셨습니다.



못다한 얘기들도 나누고 계속되는 상품 추첨으로 많은 분들이 골고루 상품을 받으셨네요~ 식사 후 즐겁게 노래도 하고 숨은 장기들도 뽐내며 단합대회가 마무리 되었습니다.



끝으로 단합대회 후 베스트 포토제닉 투표가 있었습니다.
우열을 가리기 힘들었던 아쉬운 후보작들과 베스트 사진 보여드릴텐데요 베스트 포토제닉상을 받을만한 퀄리티였다고 생각합니다!



정말 우리 人Co인들은 못하는게 없는 능력자들인가 봅니다. 일이면 일, 운동이면 운동, 노래면 노래 어느 하나 부족함이 없네요^^
행사 진행을 맡으신 구세완 선임님, 기획 해주신 박병준 팀장님, 진행요원 하느라 고생한 선수씨와 승일씨 덕분에 이번 단합대회가 좋은 추억이 될 것 같습니다.
더불어 항상 직원들을 위해 아낌없이 지원해주시는 사장님께 감사드립니다.
한 마음 한 뜻으로 승리를 위해 열심히 질주했던 것처럼 다 같이 파이팅하여 ㈜인실리코젠을 만들어 가면 좋겠습니다. 내년 人Co PLAY 2회도 기대해 주세요!^^

Posted by 人Co

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[Part 1. 프롤로그]

人Co ACADEMY 소개
人Co ACADEMY(http://edu.insilicogen.com/labkm)는 (주)인실리코젠에서 운영하는 동종업계최초 온라인교육센터로서 생물정보 소프트웨어를 활용한 다양한 교육 컨텐츠를 제공하여 생물학자들도 쉽고 간편하게 생물정보 분석을 수행할 수 있도록 지원하며, 온라인의 장점을 극대화하여 언제 어디서든 누구나 활용할 수 있는 맞춤형 교육공간입니다.

[Part 2. 제작과정]

기획 의도
생물정보 분석 컨설팅을 전문으로 하고 있는 우리는 교육이라는 단어와 굉장히 친근합니다.
특히 (주)인실리코젠의 다섯가지 사업분야 중 생물정보 소프트웨어 공급 서비스를 하는 사업분야에서 저희 만이 내세울 수 있는 큰 장점이라고 할 수 있습니다.^^

• 잠깐! (주)인실리코젠 사업분야가 궁금하시다면 여기를 보세요~
  (주)인실리코젠 홈페이지 : http://www.insilicogen.com

고객들이 생물정보 솔루션을 사용함에 있어서 어려움 없이 전문적인 분석을 수행할 수 있도록 컨설팅하는 것이 저희 마케팅팀 컨설턴트들의 사명이지만, 오프라인으로 진행하다보니 실시간으로 필요한 정보들을 제공할 수 있는 시간적 한계에 부딪히게 되었습니다. 이러한 이유로 온라인의 장점을 적극 활용한 교육센터를 만들어 정기적으로 온라인 세미나도 진행하고, 생물정보 소프트웨어 이용방법과 실시간 기술지원이 가능하도록 하면 우리 고객들에게 더 많은 지원과 소통을 할 수 있을 것이라 판단했고, 많은 고민과 기획 회의, 여러 팀과의 협업을 거쳐 드디어 人Co ACADEMY가 탄생 되었습니다!

메인 컨텐츠 선정
메인 화면 구성은 개편된 (주)인실리코젠 홈페이지 컨셉과 맞추어 교육과 관련한 다양한 컨텐츠를 보여줄 수 있게 기획하였습니다. 메인 이미지에는 특히 생물학자들도 많은 관심을 가지고 있는 생물정보 소프트웨어를 이용한 생물정보 분석 활용에 대하여 기초/응용 파트를 나누어 카테고리화 하였고, 해당 정보를 곧바로 확인할 수 있도록 관련 페이지와 연결을 진행하였습니다. 또한 예정된 온라인 교육일정을 볼 수 있도록 구글 캘린더를 이용한 스케줄 공유가 가능하도록 하였고, 원하는 온라인 교육 신청과 온라인 세미나에 쉽게 참여할 수 있도록 하였습니다. 그리고 공지사항과 문의게시판을 메인 화면에 위치하도록 함으로써 교육 관련 이슈와 궁금증들을 해소할 수 있고, 홈페이지의 블로그와 Facebook을 연동하여 (주)인실리코젠의 소식도 모두 확인할 수 있게 작업하였습니다.

메뉴 구성 및 컨텐츠 수집
人Co ACADEMY의 메뉴는 Introduction, Webinar, Document, Video, Support, (Buy) 항목으로 구성되어 있고, 전체 메뉴를 한 번에 볼 수 있도록 전체보기 메뉴효과를 선택하였습니다. 그럼 이러한 메뉴 속에는 어떠한 컨텐츠들이 있는지 알아봅시다!

1. Introduction : 人Co ACADEMY 소개와 메뉴 설명
2. Webinar : (주)인실리코젠에서 진행되는 온라인 세미나의 일정을 공유하고 해당 세미나에 대한 정보를 확인, 참여를 원하는 세미나를 직접 신청하여 온라인을 통한 교육 지원
3. Document : 생물정보 소프트웨어를 활용하여 다양한 생물정보 분석에 도움이 되는 문서 자료를 제공. 기본적인 매뉴얼을 비롯하여 조금 더 쉽게 소프트웨어를 사용할 수 있도록 각 종 튜토리얼 자료와 application note, 해당 소프트웨어를 활용하여 발표된 논문 정보 등을 확인
4. Video : 분석 파트별 툴 사용법을 이해하기 쉽도록 만든 동영상과 (주)인실리코젠에서 정기적으로 진행하고 있는 워크샵(人Co WORKSHOP)의 영상 자료, 온라인 세미나 동영상 등 원하는 교육 동영상을 플레이
5. Support : 온라인 교육센터의 공지사항 및 새로운 소식들을 확인하고, 문의에 대한 답변 게시판을 운영함으로서 생물정보 분석 학습과 기술지원을 통하여 원활한 생물정보 소프트웨어 활용 지원

그리고 지금은 숨겨져 있는 Buy 메뉴는 추후 온라인샵의 기능을 연결하여 확장할 계획입니다~

기능개발 및 디자인 적용
먼저 이번 온라인교육센터 기획 및 작업을 진행하면서 또 하나 뜻깊은 의의는 人Co ACADEMY 사이트를 자사가 개발한 솔루션인 LabKM을 이용하여 제작했다는 사실입니다. LabKM은 RESTful 위키엔진 GLTER와 연구용 지식관리 플랫폼 기반으로 소중한 정보와 경험이 언제, 어디서나 작성되고 검색되는 지식 프레임워크를 공급하여 단순 자료의 축적이 아닌 지식이 되도록하는 솔루션이랍니다.

• 그래도 LabKM이 무엇인지 잘 모르시겠다구요?
  LabKM 알아보기 : http://www.insilicogen.com/wiki/LabKM

온라인교육센터 작업을 진행하면서 필요한 추가 기능들이나 에러 수정 등의 일들이 참 많았는데, 오픈 일정에 맞추어 개발해 주시느라 개발팀 고생 많으셨고, 우리만의 기술로 만들어진 LabKM으로 프로젝트를 진행해서 그런지 더욱 애착이 갑니다.

또한 올해 개편된 인실리코젠의 홈페이지 및 블로그의 아이덴티티로 일관성 있는 디자인과 심플하고 미니멀한 박스형 레이아웃으로 기업의 세가지 컬러인 그린 & 블루, 그레이톤을 유지하여 사용자들의 컨텐츠 접근성을 높였습니다.
우리 회사의 자랑인 디싸인팀(Descign:Design+Science+Management)이 없었더라면 이러한 프로젝트 진행이 어려웠을 것입니다. 컨텐츠 기획 초안과 비교해보면 디자인의 필요성과 중요성을 아시겠지요?!

[Part 3. 에필로그]

사실 내부 프로젝트이다보니 예전부터 전체그림만 구상하다 다른 바쁜일들의 연속성 안에서 시작을 많이 망설이기도 했고, 진행에 있어서도 많은 시행착오를 겪으면서 만들어졌습니다. 마케팅팀 주관하에 만들어진 첫 프로젝트라 아직 미흡함이 많지만 여러가지 시행착오를 바탕으로 하여 좋은 경험을 쌓았고, 앞으로의 프로젝트를 더 원활하게 수행할 수 있는 능력이 생겼습니다.

작업 완료 리뷰

• 김경윤 주임컨설턴트 : 기획부터 마무리까지 이번 프로젝트 관여해주신 모든 분들 감사드리고, 언제나 여러분들이 필요한 정보를 많이 얻어가실 수 있는 그런 공간으로 열심히 운영하겠습니다! 틈틈히 찾아주시고, 부족한 부분 의견도 많이 주세요~ 그리고 작업하느라 고생한 우리 마케팅 팀원 두분에게도 감사의 인사를 드립니다.
• 송하나 컨설턴트 : 우리들의 피와 땀이 스며든 온라인 교육센터가 드디어 오픈되었습니다. 이제 처음 발을 내딛는 단계로 부족한 부분들이 많이 있겠지만, 사용자들에게 많은 정보를 제공하고 저희들의 노력이 헛되지 않도록 최선을 다해 운영해 나가겠습니다. 많은 관심 가져주세요. ^^
• 김경아 컨설턴트 : 축! 人Co ACADEMY 오픈~ 많은 人Co분들께서 소중한 시간과 노력을 쏟아 주신 덕분에 무사히 人Co ACADEMY가 탄생하였습니다. 오픈하기까지 힘들었던 부분도 많았지만 여러분들께서 관심을 가져주실때 마다 뿌듯함을 느끼고 있습니다. 한번 둘러보시면서 부족한점, 바라는점이 있으시면 마구마구 글 올려주세요(스팸글은 말구요.. )~ 여러분들의 반응 하나하나가 큰 힘이 되고 있습니다. 앞으로 더욱더 발전하는 人Co ACADEMY가 될 수 있도록 노력하겠습니다.
  

파워 유저, 당신의 목소리를 들려주세요!
온라인교육센터는 오픈 기념 사용 후기 이벤트를 진행하고 있습니다. 우리 인실리코젠에서 공급하는 세계적인 생물정보 분석 솔루션의 사용 후기와 경험들을 공유해주세요~ 베스트 후기를 선정하여 선물을 드립니다! 꼭 소프트웨어를 구매하신 분이 아니어도 응모가 가능하니 많은 관심 부탁드립니다.

• 이벤트 관련 자세한 내용은 이 곳을 참고하세요.
  오픈 기념 이벤트 참여하기 : http://edu.insilicogen.com/glter/wiki/Event

앞으로의 계획
오픈된 초창기 버전에서 그치지 않고, 꾸준히 발전하는 온라인교육센터로 거듭나겠습니다.
많이 관심갖고 지켜봐주세요! 그리고 人Co ACADEMY 관련한 문의사항은 언제든지
edu@insilicogen.com 으로 연락주시기 바랍니다. 감사합니다. ^_^

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