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양평에서 열리는 대한독성유전/단백체학회도 참석하는 동시에 하계 단합대회를 가게 되었답니다.
8월 22일부터 23일까지 1박 2일이란 짧은 시간이였지만 긴 여운을 남겨준 여행 후기를 간추려 보았습니다.
산좋고 물좋은 양평의 어느 골짜기 안에 마치 동화책 속에서 막 튀어나온 것 같은 유럽풍의 펜션들이 옹기 종기 모여 있었답니다. 우리의 숙소도 역시나 예쁘고 아담한 집이였답니다.( 기상 악화로 인해 사진 촬영이 예쁘게 나오지 못한 관계로 홍보용 사진에서 발췌하였습니다.)
전 원적인 풍경과 여유로움, 평화로움만이 가득할것 같은 이 곳에 우리를 경악하게 하는 것이 있었으니 그것은 바로 난간 없는 다리!. 글자 그대로 난감하기 이를데 없는 다리였답니다. 양쪽에 난간이 없이 계곡위에 덩그러니 놓여진 다리는 운전대를 잡으신 팀장님들의 손에 땀을 쥐게 했었지요. 자칫 계곡으로 입수할 수도 있는 위험 속에서 차안에 있던 모든 사람들 학회를 마치고 숙소로 돌아가는 길에도 여지없이 다리를 건너가야 했으니 어두운 밤이라는 옵션까지 덧붙여져 스릴 만점의 경험을 하게 되었답니다.
단 합대회에서 가장 인상 깊었던 순간은 김팀장님이 주도하신 일명 ‘자기소개’ 발표 시간이였습니다. 자신의 사진들과 해왔던 일들, 인상깊게 본 영화나 책, 앞으로 하고 싶은 꿈과 일등을 위키에 올리고 빔 프로젝터로 함께 보면서 자신에 대하여 알리는 의미있는 자리였습니다. 늘 업무적인 상황이 업데이트되는 위키에서 개인적인 이야기들이 꼬리를 물고 이어져 있어서 진풍경을 자아내기도 했습니다. 정말 하고 싶은 말과 하고 싶은 일들이 많으신 김팀장님, 그분과 정면에 앉아있다가 단박에 다음 타자로 걸려 곤혹을 치룬(?) K양, 바다사나이 규선임님, 요리와 책을 좋아하시는 현모양처형 강대리님, 남자답고 까칠해 보여도 마음은 부드러운 박대리님, 몽환적인 영화를 좋아하시는 ‘커피프린스’ 태선임님, 음악 취향이 조숙해서 모두를 놀라게 했던 영훈씨, 정치적 성향까지 적어주신 철저함이 보이는 전선임님, 사랑스러운 아기 자랑에 여념이 없으셨던 신선임님, 사진의 반쪽은 어디로 갔을까 호기심을 불러일으키신 신주임님, 최고의 사진을 띄우셔서 빛나보이셨던 정팀장님, 달콤한 연애 중이셔서 부러움과 질투를 한몸에 받으셨던 박박사님, 라이브 카페에 대한 멋진 계획을 갖고 계신 조팀장님, 야구를 좋아하셔서 야구선수와 함께 찍은 사진을 자랑스럽게 보여주신 이팀장님, 가족 사랑이 넘치시는 훈남 사장님까지... 한 분씩 이야기를 풀어나가는 모습 속에 조금 더 웃게 되고 조금 더 인간적으로 가까워지게 된 느낌은 모두가 공감했으리라 생각됩니다.
또 다른 특별했던 시간.. 서로에 대한 느낌이나 하고 싶었던 말을 솔직하게 적는 롤링페이퍼는 학창시절 종종 해봤던 이벤트였었지요. 자기소개 발표가 다른 사람에 대해 알아 볼 수 있었던 기회였다면, 롤링페이퍼에서는 다른 사람의 눈을 통해 바라본 자신에 대해 배울 수 있었습니다. 익명으로 진행된 시간이였기 때문에 조금 더 자유롭고 진솔하게 느낀 점들을 털어놓을 수 있었는데요. 덕분에 부작용이 있었다면 까칠하다는 글을 받은 한분이 충격을 받으셔서 조금더 철저한 익명속에 이루어져야겠다는 생각이 들었습니다.
돌아가는 날에는 하늘이 얄미울 정도로 화창했습니다.
아름다웠던 전원 풍경들을 뒤로 남겨두고 돌아서는 길에서 아쉬움이 남았지만 그보다도 야
외활동에 대한 미련도 컸었습니다. 덕분에 진솔한 시간을 갖기도 했지만 다음 기회에는 활동적이고 신체 단련을 도모할 수 있는
프로그램도 함께 할 수 있었으면 하는 바람도 가져봅니다. 겨울에 있는 워크샵 때는 더욱 즐거운 사건들이 펑펑 터지길
기대하며...
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지난 9월 8일 ~ 9일 양일 간 2008 추계 한국유전체학회(http://www.kogo.or.kr )가 카톨릭대학교 강남성모병원 의과학연구원에서 열렸습니다. 인실리코젠은 2층 대강당 앞에 홍보부스를 마련하여 회사소개 및 제품설명을 하는 자리를 가졌습니다. 부스를 방문하여 주신 많은 연구자 분들에게 감사하다는 인사를 드립니다.
학회 둘째날인 9월 9일에는 Lunch Workshop을 국가생물자원정보관리센터(KOBIC, http://www.kobic.re.kr )과 공동으로 주관하여 진행하였습니다. Lunch Workshop 발표는 Bioinformatics Applications for Next Generation Sequencing Technologies 라는 주제로 박준형 생물정보팀 팀장이 발표하였습니다. 주된 내용은 요즘 이슈가 되고 있는 NGS(Next Generation Sequencing) 데이터를 효과적으로 분석할 수 있는 기술에 대한 내용이었고, CLC bio사의 Genomics Workbench 라는 소프트웨어를 함께 소개하였습니다.
Lunch Workshop에 참석해 주신 분들께 점심식사와 함께 생물정보 연구지원에 대한 설문조사가 있었습니다(설문지 보기). 아래에 설문조사결과를 공개합니다.
설문에 참여한 기관은 8개 대학, 2개 연구소, 2개 기업이 참여하였으며, 설문에 참여하신 분들의 실명이나 실제 기관은 거론하지 않았음을 알려 드립니다.
설문 결과
설문조사결과, 대학에서 많이 참여해 주셨고, 직급별는 대학원생과 연구원이 가장 많았습니다. 실질적인 연구하시는 분들이 주로 참석해 주신 것 같습니다.
연 구 분야를 보면 여러 분야의 일을 하시는 분들이 참여해 주셨는데 SNP 분석, Expression 분석 쪽의 일을 하시는 분들이 많았습니다. 소프트웨어의 필요성 부분을 보면 필요하다 와 필요하지 않다가 거의 비슷한데, 이는 아직 소프트웨어를 접해 보지 못하신 분들이 있거나, 소프트웨어를 사용할 만큼의 데이터가 마련되어 있지 않아서 필요성을 느끼지 못한다는 생각이 듭니다. 컨설팅이 필요한 부분을 살펴보면, 여러가지 내용이 있는데 현재 연구자 분들이 고민하고 계시는 부분을 언급된 것 같습니다.
성심성의껏 설문을 작성해 주신 모든 분들께 다시 한번 감사하다는 말씀 드리고, 설문조사 결과를 바탕으로 더욱 더 발전해 나가는 인실리코젠이 되고자 노력하겠습니다.Posted by 人Co
차세대 염기서열 분석법(NGS; Next Genertation Sequencing)은 분석속도와 비용에 있어 생명과학 분야에 혁신을 가져올 것으로 예상된다. 아래 표는 현재까지 출시된 NGS 기술을 간략하게 비교해 보았다. Roche사의 454 기술은 새로운 종의 유전체 분석에 더 적합하고, Illumina나 ABI사의 기술은 알려진 유전체에서 variation을 연구하는데 더 적합할 것으로 생각된다.
기술 |
Roche 454 GS FLX |
Illumina Genome Analyzer |
ABI SOLiD Platform |
응용분야 |
새로운 유전체 분석, resequencing, 발현체분석, 유전자조절연구, epigentic changes, 메타지놈 및 미생물다양성 연구, paleogenomics analysis |
Resequencing, 발현체 분석, 유전자 조절 연구, ChIP, 작은 유전체에 대한 새로운 시퀀싱(paired-end 방법), epigenetic changes |
Targeted resequencing, 유전자 발현, microRNA 발굴, ChIP, 전체 유전체 재분석(resequencing) |
가시화 |
Light from chemical reaction |
형광 표지에 의한 색상 |
4가지 형광 표지 |
Read length (한번에 읽을 수 있는 bp) |
200 ~ 300 |
25 ~ 40 |
35 |
1회 분석시 생성 서열 |
80 million 이상 |
1 billion 이상 |
3 billion 이상 |
1회 분석 시간 (Run time) |
7.5 hr |
3 days, 6 days (paired-end 분석의 경우) |
fragment lib: 4 days |
샘플 수 |
1회 분석시 2, 4, 13 샘플처리 가능 |
8 샘플 |
1 ~ 16 샘플 |
Single-read 정확도 |
99.5% |
99.9% |
97% |
오류의 종류 |
Homopolymer errors, phase errors, chimaeras, duplicated fragments |
리드 말단에서 정확도가 떨어지는 경향이 있음 |
Mis-incorporated bases |
Multiplexing |
최대 16 samples/plate, bar-coding tag 개발중 |
8 samples/slid, bar-coding tag 개발중 |
4 samples/slide, bar-coding tag 개발중 |
Paried-end reads |
가능; 리드 사이즈 250 bp, 인서트 크기는 가변 |
가능; 리드 사이즈 25bp, 인서트 사이즈 250bp, 500bp contiguous fragments, 1~15kb pairs library pairsings |
가능; 리드 사이즈 25bp, 인서트 사이즈 3kb~8kb |
생물정보학적인 입장에서 NGS는 과거의 이슈를 새롭게 부각켰다. 한동안 생물정보 분야에서 정보 처리 속도와 염기서열 데이터 통합은 이미 해결된 문제처럼 보였으나, NGS가 등장하면서 새로운 도전에 직면한다. 즉, NGS 기기를 1회 작동시키면 8천만에서 30억 bp의 염기서열이 쏟아지는데, 이를 한 주에 1~2회만 운용해도 그 자료랑은 엄청난 분량이된다. 이러한 상황에서 대규모의 서버를 구성해서 처리하는 것은 당연한 접근법이지만, 국내 실정에서 이를 위해 필요한 인력과 고정 비용을 생각하면 결코 만만치 않은 것이다.
대표적인 어셈블리 소프트웨어인 phred/phrap/consed도 NGS 데이터를 다룰 수 있도록 개정되 고 있다고 한다. 워싱턴 대학에서 제공되고 있는 phred/phrap은 2000년 이후로 알고리즘 측면에서는 이렇다할 업데이트가 없는 실정이지만, consed는 꾸준한 업데이트로 기능이 향상되고 있다. 하지만 consed를 사용해본 독자라면 윈도와 다른 그래픽 유저 인터페이스에 조금 실망하고 그 메뉴얼의 방대함에 질려본 적이 있을 것이다.
최근 서버가 아닌 노트북이나 데스크탑에서 NGS 데이터를 믿을 수 없느 속도로 처리할 수 있는 소프트웨어가 소개되었다. 덴마크의 CLC Bio사에서 제공하는 CLC Genomics Workbench라 는 제품으로대형 서버에서 병렬처리형 phred/pharp에서 수 일이 걸리던 어셈블리를 몇 가지 제약은 있지만, 단 수 시간만에 처리한다. 비교 성능이 믿기 어려울 만큼 빨라 과연 지금 소개해야 할지 의문이 들 정도이다. 포화상태인 것 처럼 보이던 어셈블리 분야에서 혁명을 이끌어 냈다는 생각이 든다. 현재 덴마크 NGS 연구 그룹에서 소프트웨어 플랫폼으로 활용되고 있다고 한다(기사읽기).
또한 FGENESH FGENESH+라는 유전자 예측 소프트웨어로 유명한 Softberry Inc에서도 NGS를 OligoZip를 출시하였다. 미생물 유전체 분석을 실제로 수행한 결과는 기존의 어셈블리 프로그램보다 우수한 clustering 결과를 얻었다고 한다1. Solexa sequencing을 통해서 얻어진 작은 서열들을 모아서 reference가 없는 새로운 genomic 서열 구성하거나, 동일종 또는 비슷한 종의 서열을 참고로 genomic 서열 구성할 수 있다. 그리고, 주어진 유전자에 대하여 돌연변이 검출이나 SNP discovery에도 효과적이라고 한다.
인간유전체 발표후에 기대에 비해서 체감할 수 있는 변화가 미비했었지만, NGS의 출현으로 생물정보학의 역할에 대해서 환기되는 새로운 전기가 될 것으로 기대하며 NGS와 관련 프로그램에 대해서 간략히 살펴보았다.
1 Bioinofrmatics, 2007, 23(4):500-501
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글로벌 기업으로 발전하고 있는 CLC bio사에서 얼마 전 Video Podcasting 서비스를 시작하였습니다. 이 서비스의 핵심은 어디서나 손쉽게 CLC bio사의 제품설명과 동영상 자료를 볼 수 있도록 하는 것에 있습니다. CLC bio사는 최신의 IT 기술을 동원해서 마케팅에 주력하고 있는 모습을 보여주고 있습니다.
이제 어떤 방식으로 서비스를 하는지 알려드리겠습니다.
itunes를 사용하고 계시다면, itunes를 실행하여 고급 -> Podcast 등록에 아래 주소를 복사하여 넣으시면 됩니다.
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itpc://clcbio.blip.tv/rss/itunes/ |
위에 내용에 대한 원문 기사를 보시려면 아래 주소를 클릭하시기 바랍니다.
http://www.clcbio.com/index.php?id=1342Posted by 人Co
가축유전자원 종합관리시스템은 농촌진흥청 축산과학원 가축유전자원시험장에서 주관하는 사업으로, 작년에 이어 올해에도 계속 실시하고 있습니다. 물론 작년에 이어 올해에도 (주)인실리코젠에서 사업을 수주하여 개발을 진행하고 있습니다.
가축유전자원 종합관리시스템은 소와 돼지, 닭, 염소 등 국내 사육되는 가축의 외모와 발육 특성은 물론 유전자 특성에 대한 개체 정보와 집단 정보 등을 담고 있습니다. 그리고, 가축유전자원 정보의 국제 표준화에 대비하여, 모든 내용을 영어로도 서비스 합니다. 또한, 가축유전자원 관련 정보를 전국의 유전자원 관리기관에 서비스하며, 일반 축산인도 인터넷 회원 가입을 통해 기본 정보와 검색 서비스를 이용할 수 있게 하였습니다.
올 해에는 작년에 구축한 시스템을 기반으로 좀 더 사용자 친화적이고, 사용하기 용이한 시스템을 만들기 위해 동분서주하고 있습니다. 아래 그림은 2008년 7월 경에 있었던 사업 착수보고회 현장 사진을 담아 보았습니다. 착수보고회 때에는 이 사업과 관련된 각 도 기관 연구자 분들이 참석을 해 주셨고, 더 좋은 시스템을 만들기 위해 열띤 토론을 벌이는 모습도 보여지고 있습니다.
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착수보고회 화면 |
본 사업의 PM을 맡고 있는 김형용 팀장 |
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열띤 토론 현장 1 |
열띤 토론 현장 2 |
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인실리코젠에서는 내부적으로 독서경영 마인드를 고취하고 새로운 아이디어를 키워가고자 하는 의도에서 주기적인 독서토론회를 진행하고 있습니다. 9월 11일 "상식이 통하는 웹사이트가 성공한다"는 책을 가지고 독서토론회를 했는데요, 살짝 어떤 이야기들이 오고갔는가를 공개하고자 합니다.
이 책의 선정 이유는 "디자인", "사용자인터페이스"가 강조되고 있는 최근의 웹 환경에 있어서 경쟁력을 갖추고, 사용성이 뛰어난 웹어플리케이션을 만드는 노하우를 전 직원이 공유해야 할 필요가 있었기 때문입니다. 어떤 이야기들이 오고 갔는지 볼까요.
지식관리팀 김형용 팀장
Web usability, web accessibility 에 대해 언급하고 있다. 또한, 개발자와 디자이너사이에서 보다 더 나은 협력방안을 소개하고 있다. 그리고, 사용성 테스트에 대한 중요성도 소개되어 있다.
좋 은 User interface 란 어떤 것인가에 대해 전부는 아니지만, 몇몇 중요한 점들을 알아 볼 수 있었다. 당사 제품의 UI들은 어떤 방향이어야 하는가. 개발자도 달랑 그 기능만을 구현하는 것이 아닌, 어떻게 해야 사용이 편리할까를 고민해야 하며, 디자이너도, 단순한 이쁨 보다는 실용성에 기반한 명료함, 일관성을 유지해야 할 것이다.
마지막으로, 웹사이트에서 가장 중요한 점 가운데 하나였던 "신뢰". 바르고 정직한 정책이야 말로, User interface 만큼이나 중요한 점일 듯 싶다. 전 직원 모두가 회람해서 읽어볼만하다.
공공사업팀 이기용 팀장
새 롭게 구매가 되었다고 하니 어서 읽어야 될 것 같다. 예전부터 우리회사 책장에 꽂혀있던 책이라 읽어보았던 기억이 난다. 가장 기억에 남고 지금 우리 회사에 필요하다고 생각했던 부분은 웹디자인은 직관적이어야 한다는 것이다. 즉 이 버튼을 클릭하면 어떤 정보가 나올 것이라는 것이 예측되어야 한다는 것이다. 아울러 사용자가 클릭할 버튼을 직관적으로 알 수 있어야 한다는 것이다. 이 버튼은 어떤 기능을 할려고 만든건지 고민을 하게되면 안된다는 것이다.
처음 읽을 때 다 읽지 못했던 기억이 난다. 책이 두껍고 또 비슷한 내용이 반복적으로 되풀이되다 보니 재미없던 책으로 기억한다. 각 파트별로 맡은 부분을 읽고 우리회사에 적용할 수 있는 부분을 나눌수 있는 기회가 되었으면 한다.
생물정보팀 이태호 선임연구원
사 용하기 편리한 웹사이트를 만든다는것은 지극히 당연하고, 자연스러운 것이다. 특히나 웹을 사용할 뿐만 아니라 개발자로서 약간의 의무감 같은것도 느끼게 된다. 책에서 다루는 내용은 식상한 내용일 수도 있다. 어떻게 보면, 사이트제작시 참고해야하는 가이드라인정도로 비춰질 수 있다. 하지만, 사용자가 웹을 상대할때에는 보이는 화면에서 모든것을 해결해야 한다. 코드를 만든사람라면 링크를 클릭했을때 어디로 갈지 알겠지만, 사용자입장에서(특히나 처음 사용한다면)는 사무실문을 열었는데, 갑자기 산꼭대기에 와있는 경험을 할 수도 있다. 이런점을 감안한다면, 이책에서 제시하는 기본적인 골자는 매우 중요하다고 할 수 있다. 기본적이며, 정말 상식적인 내용이다. 그렇지만, 우리는 종종 이런룰이 깨지는 경우를 많이 경험하지 않는가? 이런부분을 상기시키고 사용자를 배려하는 웹사이트제작을 위해서라면, 이책을 한번쯤 읽고 곰곰히 생각해볼 필요가 있다고 생각한다.
생물정보팀 신윤희 선임연구원
웹 사이트 사용자로서 나 스스로도 의식하지 못했던 너무나도 당연스런 얘기들을 하나하나 꼬집어주는 참 교과서 같은 책이다. 무언가를 찾으려 웹사이트를 찾아 헤메다 어느 순간 애초에 무엇을 찾으려 했는지 그 목적을 잊은 적도 많고, 어디에 무엇이 있는지 순간 당황스러웠던 페이지도 많았으며, 원하는 답을 기분좋게 얻은 페이지는 즐겨찾기에 바로 링크했던 적도 많다. 그래서 책에서 강조했듯이 다수를 대상으로하는 웹페이지니 만큼 상식을 지켜가며 개발을 해야하는 것이 굉장히 중요할듯하다. 문제는 어디까지가 상식선인지를 깨닫는것인데 많은 경험은 기발한 아이디어로 인한 변화와 상식선을 적절히 융화 시켜줄 중요한 수단이라 생각들었다.
지식관리팀 전철욱 선임연구원
책을 다 읽지는 못했지만 책의 행방이 묘연한 현재 상황에서 140페이지 정도까지 읽은 상태로 잠깐 써본다.(수배해서 다 읽는대로 update하겠음) 읽 으면서 개인적인 생각으로는 단순한 UI이 이야기가 아닌 전 시스템에 대한 이야기 같았다. 여기서는 사용자의 편의성(Usability)을 강조해서 이야기 했지만 시스템에 따라 약간의 조건이 다를 수도 있다. 만약 편의성보다는 기능성을 강조한다면 UI는 또 다르게 변해야 할 듯 하다. 이렇게 조건에 따라 약간에 차이가 생길 수 있지만 시스템은 전체적으로 유기적으로 움직여야 한다는 것. 단순히 위치조정정도야 어떻게 해도 (사용자의 편의나 기타 조건에 따라) 괜찮겠지만 단순한 위치조정이 아닌 것들은 전체적인 사이트의 concept을 고려해야 하고 각 기능들은 충돌나지 않아야 한다. 이를 위해서는 기획부터 이를 고려해야 할 듯 하다. UI가 사용자의 편의성을 위해 만들어야 하는 것은 이책에서 잘 알았다. 하지만 기획에서부터 프로그래밍까지 일괄적이고 명확해야 사용자의 편의성은 확보되지 않을까?
R&D센터 강병철 센터장
이 책을 가장 잘 설명한 어구는 표지에 있는 Don't Make Me Think!이 다. 개발자나 기획자는 개발중인 사이트에 고민도 많이하고 사전지식도 많이 습득한 상태이며, 무엇 보다도 그 사이트에 대한 애증(?)을 가지고 있다. 그래서 우리 모두(개발자/기획자) 잘 잊어버린다. 다른 사람들이 얼마나 게으른가 그리고 얼마나 이 사이트에 대해서는 무식한가에 대해서! 웹을 이용하는 사람 대부분은 검색이나 자료탐색을 하기 위해서 방문한다. 즉, 방문한 웹의 충성스런 사용자도 아니며 원한는 자료를 제외하고는 별 관심이 없다. 그래서, 그들에게 생각하게 만들거나 머뭇거리게 만들면 다시 방문하지 않는다는 것! 이 책은 이런 함정에 빠지지 않고 어떻게 성공적이 웹을 구현하는 가에 대한 충고를 하고 있다. 그러나 주종관계를 무색케하는 갑과 을의 관계, 동시다발적인 프로젝트 수행, 예정에 없던 요구사항, 전시(display)행정을 위한 웹 구현 등 국내 현실에 적용하기 위해서는 나름의 선택과 집중이 필요하다. 또한 회사 구성원 모두 책을 읽고(reading) 이해(understanding)를 했지만, 정말 회사의 지식으로 되기 위해서는 어떻게 습득(learning)할 것인가에 대한 고민이 필요하다.
오 늘 디자인팀, 지식관리팀과 함께 점심식사를 하면서 이 책에 대한 이야기를 나누었다. 개발자 입장에서는 책에서 제안하는 가이드를 내키지 않는 것들이 있다고 한다. 짧은 시간이라 깊게는 이야기 할 수 없었지만 우리가 개발하는 사이트와 책에서 예시하는 사이트의 특성이 달라서 그럴 수 있고, 또는 개발방법론적인 시각차가 있어서 그럴 수 있다. 좀 더 일찍 이런 이야기가 나왔다면 견해차가 있는 이슈들을 도출하고 좀더 깊이 있는 토론이 될 수 있었을 것 같다. 그리고 이런 제안도 해봤다. 현재 회사에서 개발한 사이트 "우리회사 LabKM", "VSD" 등을 이 책에서 말하는 관점에서 점수를 매겨보고 자평을 해보는 표를 만들어보면 어떨까? 귀찮은 일인지... 또는 내키지 않는 잣대로 점수를 매기는 것에 대한 거부감인지... 좋은 반응은 나오지 않았다. 하지만 실무적으로 적용해봐야 어떤 잣대를 취사선택할지 객관적인 자료를 만들 수 있지 않을까?
디자인팀 정은미 팀장
디 자인은 어떤 목적을 달성하기 위해 계획하고 합리적으로 구성하여 유기적 통일을 얻기 위한 창조활동이다. 디자인은 관념적인 것이 아니라 실체이기 때문에 어떤 종류의 디자인이든 대상을 떠나서는 이루어질수 없다. 웹디자인에서도 마찬가지로 고객을 설득하고 만족스러운 결과물을 얻기 위해서는 충분히 타겟을 분석하고 프로젝트의 목적과 수행계획을 진행하는 웹기획 단계를 필수적으로 거쳐야 한다. 특히, 자사의 규모에서는 UI기획능력을 배양해야할 필요성이 있으며, 왜 이렇게 디자인하여야 하는지에 대한 의견을 분명히 말할 수 있는 충분한 자료를 스스로 확보하여야 한다.
또한, 웹프로젝트는 혼자 수행하는 것이 아니며, TFT(TASK FORCE TEAM)의 상호협조하에 이루어진다. PM은 기획, 디자인, 개발자가 하나의 소리를 낼 수 있는 오케스트라의 지휘자가 되어야 한다.
생물정보팀 이규열 선임연구원
홈페이지가 흔히들 디자이너가 만드는 것, 개발자가 만드는 것이라고 착각하기 쉽다. 훌륭한 웹사이트란 무엇인가? 삐까번쩍하고 '우와' 라고 감탄사를 절로 내뱉게 만드는.. 이런 사이트가 훌륭한 사이트일까?
누 가 깔끔하게 디자인을 하던, 군더더기 없는 코드를 완성하던, 다듬고 다듬은 기획이던간에 중요한 것은 이 세가지 모두가 아니다. 기획, 개발, 웹디자인의 삼박자가 균형있게 진행되는 사이트에 사용자의 입장을 최대한 고려한 사이트가 훌륭한 사이트이지 않을까? 아주 간단하지만 슬쩍 잊어버리거나 내 고집을 피워서 홈페이지를 처음 만들때의 의도와는 달리 많이 변형된 사이트가 되지는 않았는지.. 기획자와 디자이너, 개발자들의 문제가 서로 아우러져 서로의 의견이 서로 상충하면서 사용자들의 편의성은 무시되어진 사이트가 등장하는게 아닐까?
사 이트 이용자에게 고민할 꺼리를 주지마라, 고민을 조금 해서라도 이해하고 익숙해지면 이용할 것이라고 자기위안으로 삼지말라, 글자 크기를 다르게 하든 여백을 살리든 사용자가 한번 보면 척~하고 이해가 가는 삼척동자도 알만한 사이트를 만들어라. 우리가 늘상 알고는 있지만 무심코 지나치는 그런 부분을 세심하게 살리는 사이트가 되어야 할거 같다.
여 담: 이책을 읽고 느끼는 점은 '프리젠테이션 젠'이라는 책을 읽었을 때의 느낌과 비슷하다. 읽으며 '아~~'하고 절로 수긍하게 만드는 그 무엇인가가 있다고 해야할까? 발표를 잘하는, 내 의사를 정확히 전달해서 상대를 설득하는 프리젠테이션이나 웹사이트에서 사용자에게 이 사이트의 특징과 내용을 잘 전달해서 이용하게끔 만드는 것에는 서로 무언가의 공통점이 있지 않을까? 발표자료는 발표자료다워야 한다는. 웹사이는 웹사이트 다워야한다는 기본원칙을 우린 너무 간과하고 있는걸까? " ~답다" 라는 말이 새삼떠오른다. 남자는 남자다워야하고 뭐 이런 말이 웹사이트에는 적용되지 말라는 법이 있을까? 버튼은 버튼답게, 링크는 링크답게.. 잘 알지만 슬쩍슬쩍 넘어가지는 않았나 싶다.
적절한 여백과 간결, 명료함, 그리고 내가 전달하고자 하는 핵심 이것들은 발표에서나 웹사이트에서나 서로 공통적이지 않나싶다. 상대방을 충분히 납득시키고 기억에 남는 무언가를 주던, 사이트에서 검색이나 버튼같은 것들이 의도하는바와 같이 분명하다면 청중이나 사이트 이용자들이 고민없이 받아들이고 잘 사용할 수 있지 않을까?
(이상, 직원들의 독서감상이였습니다. 앞으로 당사의 독서토론 내용을 블로그로 꾸준히 소개하려고 합니다. 많이 기대해주세요)Posted by 人Co
CLC Bio사는 포화 상태처럼 보이던 PC용 생물정보학 소프트웨어 시장에서 혜성처럼 등장한 덴마크 기업으로 최근 CLC Main Workbench와 CLC Genomics Workbench로 글로벌 시장에서 좋은 반응을 얻고 있습니다.
본 글은 CLC Bio사의 CLC Combined Workbench 국내 이용현황을 정리한 것입니다. 보통 이런 자료들은 회사의 영업기밀이 될 수 있지만, 후발 기업임에도 불구하고 글로벌 시장에서 좋은 반응을 보이는 회사에 대한 정보를 공유함으로써 국내 생물정보학 기업과 종사자들에게 신선한 자극이 되고자합니다.
아래 그래프 정보는 2006년도부터 2008년 6월까지 국내에서 CLC Workbench제품을 다운로드한 사용자 정보를 토대로 운영체제별, 제품별, 기관별, 직급별 통계 현황을 나타낸 것입니다. 해당 기간동안 총 787명이 CLC Workbench를 다운로드 하였으며, 중복 사용자는 제외하였습니다. 그리고, 정확히 입력된 정보 외에 알 수 없는 정보들은 제외하였습니다.
CLC Workbench 제품은 컴퓨터 운영체제인 Windows, Mac, Linux에서 모두 사용 가능합니다. 통계 수치를 보면 Windows가 96%로 대다수의 연구자 분들은 Windows 운영체제에서 많이 사용하고 계시다는 것을 알 수 있습니다.
CLC Workbench 제품은 무료로 사용할 수 있지만 기능에 제약이 있는 Free Workbench, DNA 레벨에서 사용하는 DNA Workbench, RNA 레벨에서 사용하는 RNA Workbench, Protein 레벨에서 사용하는 Protein Workbench, Gene 레벨에서 사용하는 Gene Workbench 그리고, 이 모든 기능을 모두 포함하고 있는 Combined Workbench가 있습니다. 모든 기능을 가지고 있는 Combined Workbench가 62%로 가장 많이 다운로드 되었음을 알 수 있습니다.
현황을 보면 대학교가 80%로 기업이나 연구소, 병원보다 많이 다운로드 되었다는 것을 알 수 있습니다.
연구자 분들의 직급별 통계를 보면 연구원 분들이 37%, 학부생(졸업생 포함)이 38%로 집계 되었습니다.
CLC Bio사
제품에 대해서 국내 사용자의 이용현황을 분석한 결과, 기관별로 보면 대학교에서 많은 관심을 가지고 있다는 것을 확인할 수 있었습니다. 이는 대학교가 기초연구
비중이 높은 것과 새로운 기술과 표현방법에 대해서 관심이 높기 때문일 것으로 생각됩니다. 특히, 학사 사용자가 많은 것은 실제 사용을
위해서 다운로드한 경우도 있지만, 단순 호기심에 의해서 다운로드한 비율도 꽤 될 것으로 예상됩니다. 그렇지 않다면 아직 대학교에서
"생물정보학"은 컴퓨터에 관심 많은 "어린" 학생들에게 시키는 관행이 여전한 것으로 생각될 수도 있을 것입니다. 상용 제품인 만큼 실제 구매력이 있는 소비자의 관심 비중이 높아갈 때 국내 생물정보학 산업에 더 큰 희망이 있을 것입니다.
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지난번 골라읽는 학술정보, RSS를 이용하여 내 분야의 최근 연구현황 파악하기를 통해서, 나의 관심 연구분야를 RSS로 받아봄으로써, 최근의 연구현황을 놓치지 않는 방법을 알아봤습니다. 당시, PubMed의 논문검색결과는 RSS로 제공되지 않는다고 말씀드렸었는데, 아니였습니다. Send to 라는 콤보박스 아래에 숨어있더라고요. 역시나 NCBI는 기대를 저버리지 않는군요. (biopython과 NCBI E-util로 만들어보려고 했는데, 찾아내서 다행입니다.)
먼저, 나의 관심 키워드를 검색해봅니다. http://www.ncbi.nlm.nih.gov 에 방문하여, 검색대상을 PubMed로 놓고, 제가 예전에 연구했던 selenocysteine을 입력해보겠습니다.
Preview/Index 탭을 열어보면, 나의 키워드를 조합해볼 수 있습니다. 1324개의 검색결과중에서 인간(human) 관련 논문만 보고싶다면,
검색결과를 546개로 줄일 수 있었습니다. 위 방법으로 검색필드 및 검색조건을 수정할 수 있습니다. 543개의 검색결과보기를 클릭하면, 다음의 검색결과 화면이 나옵니다.
"Send to" 라고 된 부분을 클릭하면, RSS Feed 라는 항목이 나옵니다. 이를 선택하게되면,
화면이 나오며, "Create feed"를 선택하면, 자주봤던 XML 아이콘이 보입니다.
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