생.기.다 프로젝트 제2탄 ★연말연시 프로모션★ - CLC Main Workbench
- Posted at 2017/12/15 13:38
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이때, transcription factor가 부착하는 위치를 transcription factor binding site(TFBS)라고 합니다. 이러한 유전자 조절에 중요하게 작용하는 transcription factor binding site들의 정보들을 제공하고 분석할 수 있는 툴인 TRANSFAC에 대해서 소개하려고 합니다.
TRANSFAC은 geneXplain사에서 제공하는 데이터베이스 겸 분석툴로써 진핵생물의 transcription factor나 binding site, 유전자나 단백질, pathway 등에 관한 다양한 정보들을 담고 있습니다.
그 중, 가장 주된 기능은 positional weight matrix(PWM)의 라이브러리를 활용하여 서열 내의 TFBS를 예측하는 것입니다. TFBS 분석은 일반적인 방법으로 분석하는 Match, 한 쌍의 TF를 찾아주는 composite model과 overrepresented TFBS를 찾아주는 FMatch가 있습니다. 가장 보편적으로 사용되는 방법은 Match 방법으로 미리 큐레이션 되어 있는 Matrix를 가지고 TFBS를 예측합니다.
TFBS 예측을 위해서는 Matrix 리스트들이 있어야 하는데 이 list들이 만들어지는 패턴은 아래와 같습니다.
다양한 논문 등으로부터 수집되어진 TFBS 서열을 행렬로 만들어 PWM 라이브러리를 생성합니다. 이 라이브러리를 이용하여 input으로 넣어준 서열과 설정해둔 cut-off 값에 따라 해당하는 PWM을 검색하여 서열상에서 TFBS을 유추할 수 있습니다.
아래의 실제 wizard를 함께 보시죠.

분석할 파일을 넣고 method에서 Match, FMatch, composite model 중 원하는 분석을 선택한 다음 cut-off 값을 세팅하여 분석을 진행하면 아래와 같이 TFBS를 예측하여 결과를 보여줍니다.
분석한 서열상에 존재할 수 있는 모든 TFBS들을 테이블 형태로 보여주며 matrix ID를 클릭하게 되면 해당 matrix에 대한 자세한 정보를 확인할 수 있습니다.
또한, Matrix는 어떻게 구성이 되었는지 reference 정보와 서열 그리고 어떤 실험을 통해 증명된 데이터인지 리포트를 통해 확인할 수 있습니다.
이처럼 TRANSFAC을 이용하면 binding site를 쉽게 예측할 수 있으며, 해당하는 transcription factor 정보 및 관여하는 유전자 정보 등 전문가 큐레이션을 통한 신뢰도 높은 다양한 정보들을 한 번에 확인할 수 있습니다.
* Trial을 원하신다면 codes@insilicogen.com 혹은 031-278-0061으로 문의주시기 바랍니다.
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• 일시 : 2017년 11월 30일(목)~ 12월 1일(금)
• 장소 : KT인재개발원 1연수관 203호
내용
R을 이용한 프로그래밍 집중 단기 학습을 통해 생물정보 데이터 분석 실무 능력을 습득할 수 있습니다.
(자세한 프로그램 내용은 http://kobicedu.labkm.net 참고)
신청방법
• 신청기간 : 2017년 11월 6일(화) ~ 2017년 11월 9일(목)
• 선발인원 : 30명
• 교육대상 :
1) R 교육을 통해 생물정보 분석을 하려는 기본 리눅스 terminal 명령어
사용 가능 연구원, 대학원생 등
사용 가능 연구원 및 대학원생 등
2) 모든 교육 일정에 참석이 가능한 교육생 (2일 일정 필수 참석)
• 선발안내 : 2017년 11월 10일(금)
• 교육비 : 무료 (중식 무료제공)
• 준비물 : 유무선 인터넷이 가능한 개인 노트북
• 신청방법
- 온라인 신청 http://kobicedu.labkm.net
• 문의
- ㈜인실리코젠 (
031-278-0061, edu@insilicogen.com)
- 문의게시판 이용 http://kobicedu.labkm.net/labboard/board/QnA
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8) 13주년 창립기념일 행사를 마무리하며…
처음으로 준비한 창립기념일 행사라 미흡한 부분도 있었지만 늦은 시간임에도 13주년 기념 행사에 참석해주시고 즐겨주셔서 너무나도 행복한 시간이었습니다. 13주년을 함께 해주신, 앞으로 맞을 14, 15주년 그 이상을 함께 할 모든 人Co인분들께 이 자리를 빌려 감사의 말씀을 전합니다.

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• 일시 : 2017년 10월 24일(화)~ 10월 25일(수)
• 장소 : KT인재개발원 1연수관 203호
내용
프로그래밍 언어 파이썬 집중 단기 교육을 통해 생물정보 데이터 분석 실무 능력을 습득할 수 있습니다.
(자세한 프로그램 내용은 http://kobicedu.labkm.net 참고)
신청방법
• 신청기간 : 2017년 10월 10일(화) ~ 2017년 10월 12일(목)
• 선발인원 : 30명
• 교육대상 :
1) 파이썬 교육을 통해 생물정보 분석을 하려는 기본 리눅스 terminal 명령어
사용 가능 연구원 및 대학원생 등
2) 모든 교육 일정에 참석이 가능한 교육생 (2일 일정 필수 참석)
• 선발안내 : 2017년 10월 13일(금)
• 교육비 : 무료 (중식 무료제공)
• 준비물 : 유무선 인터넷이 가능한 개인 노트북
• 신청방법
- 온라인 신청 http://kobicedu.labkm.net
• 문의
- ㈜인실리코젠 (
031-278-0061, edu@insilicogen.com)
- 문의게시판 이용 http://kobicedu.labkm.net/labboard/board/QnA
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생물정보 전문기업 ㈜인실리코젠은 2005년에 설립하였으며, 노동부가 선정한 청년친화 강소기업입니다.
또한 당사는 독자개발한 신기술 특허(3건)를 포함하여 다수의 지적재산권을 소유하고 있으며, 신용보증기금이 선정한 올해의 베스트서비스기업으로써, IT와 BT가 융합한 바이오 빅데이터 및 DB 구축 전문기업입니다.
바이오 빅데이터 관련 SI 구축 및 시스템 개발을 하고 있으며, 빠르고 신뢰 높은 고객 맞춤형 생물정보 분석 서비스를 제공하고 있습니다.
당사의 사업확장 및 담당인력 충원 등으로 해당 업무를 담당하실 인재를 모집하오니, 관심있는 분들의 많은 지원 바랍니다.
[상세모집요강]
[전형절차]
※ 신입의 경우 서류전형 접수기간이라도 적합한 인재가 있을 경우 조기 면접이 진행 될 수 있습니다.
[채용형태]
- 정규직 : 0명(계약직 3~6개월, 업무평가 후 정규직 전환 검토)
[근무환경]
- 근무제 : 주 5일 근무
- 복리후생 : 4대보험, 퇴직연금 및 성과급, 유연근무제(장기근속자)
- 휴가제 : 연차, 경조사휴가, 충전휴가(장기근속자)
- 지원 : 경조비, 주차비, 체력단련비, 아침식사, 교육훈련비, 도서 등 지원
[접수기간 및 방법]
1) 서류전형 마감일 : 2017.09.29
2) 제출방법 : E-mail(보내시는 곳 : ms@insilicogen.com)
[제출서류]
1) 서류전형
① 자사 입사지원서 : 파일명 `입사지원서_성명_지원분야.docx`으로 저장
2) 면접전형(서류전형 합격자)
① 포트폴리오(PDF) 제출 및 발표(자기소개 및 경력위주, 5분 이내)
3) 3차 서류제출(2차 임원면접 합격자에 한하여 개별통보)
① 건강검진확인서 및 병력확인서 제출
② 전 근무지의 근로자원천징수영수증(퇴사연도 or 직전연도)
③ 고용보험이력확인서 : 고용보험 사이트에서 발급 가능
4) 최종합격 후 입사 시 :신원보증보험증권 제출
[기타사항]
1) 기본예의 등 소양이 되어 있는 자
2) 해외 출장이나 개인 신용에 결격사유가 없는 자
3) 채용절차 진행 중 당사에 부합하는 지원자가 조기 채용 시 본 채용공고는 위 일정과 상관없이 종료될 수 있습니다.
4) 최종합격 후 입사지원서 및 제출서류 내용에 허위사실이 발견될 경우 채용이 취소될 수 있습니다.
5) 절차별 합격자는 E-mail을 통해 개별 안내해 드립니다.
6) 연봉 : 회사내규 및 경력에 따른 협의, 희망연봉 기재요망
[문의처]
- ㈜인실리코젠 채용담당자 / 031-278-0061(내선720번)
- E-mail을 통해 문의하여 주시기 바랍니다.(ms@insilicogen.com)
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• 일시 : 2017년 7월 24일(월)~ 7월 25일(화)
• 장소 : KT인재개발원 1연수관 204호
내용
Metagenomics의 기본 이론을 확립하고 실습을 통해 생물정보 기초 분석 능력을 습득할 수 있습니다.
(자세한 프로그램 내용은 http://kobicedu.labkm.net 참고)
신청방법
• 신청기간 : 2017년 7월 10일(월) ~ 2017년 7월 12일(수)
• 선발인원 : 30명
• 교육대상 :
1) 분석에 앞서 기초적인 Metagenomics 교육이 필요한 연구원 및 대학원생 등
2) 모든 교육 일정에 참석이 가능한 교육생 (2일 일정 필수 참석)
• 선발안내 : 2017년 7월 14일(금)
• 교육비 : 무료 (중식 무료제공)
• 준비물 : 유무선 인터넷이 가능한 개인 노트북
• 신청방법
- 온라인 신청 http://kobicedu.labkm.net
• 문의
- ㈜인실리코젠 (
031-278-0061, edu@insilicogen.com)
- 문의게시판 이용 http://kobicedu.labkm.net/labboard/board/QnA
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