기생충과 우리와의 관계를 유전체적으로 살펴본다면....
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지난 더운 여름, EBS 다큐프라임에서 재밌는 이야기 하나를 보았습니다. "기생충과 우리는 함께 진화해 오고 있다." 그저 징그럽고 혐오스러웠던 하등한 기생...
R을 이용해 벤다이어그램(venn diagram) 그리기
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열심히 연구한 결과를 논문이나, 포스터, PPT 등으로 발표할 때 연구 결과를 잘 전달 할 수 있는 figure, 소위 이야기 하는 '예쁜 그림'을 이용해 보여주는...
바이오빅데이터의 작은 이야기
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1. 개요 최근 들어 빅데이터가 상당히 큰 이슈가 되고 있다. 박근혜 정부의 가장 큰 흐름 중 하나가 빅데이터라는 이야기를 쉽게 접할 수 있는 상황이다. 신...
NGS 데이터로부터 유전체 크기를 예측하는 방법
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이번 블로그에서는 NGS 데이터로부터 미지의 유전체 크기 (genome size)를 in silico적인 방법으로 예측하는 것에 대해 얘기해보려고 합니다.Genome size의...
NCBI2R 패키지를 이용한 NCBI dbSNP 정보 이용하기
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우리는 Genomic 데이터를 분석할때, 온라인 데이터베이스를 이용해서 정보를 검색하고 이용하기 위한 여러가지 도구를 사용합니다. 많이 활용되는 온라인 데...
The olfactory receptor gene analysis in the pig genome (부제 : 돼지의 재발견)
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돼지를 아시나요? 회식을 할 때 마다 빠지지 않는 터줏대감 삼겹살을 생각하시나요? 아니면 지저분하고 더러운 동물, 이도 아니라면 부와 행운의 상징인 돼지...
Nsp2 유전자의 긴 indel을 검사하는 방법 (How to find a long indel from Nsp2 alignment)
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배경 돼지생식기 호흡기 증후군 (Porcine reproductive and respiratory syndrom)은 PRRS 바이러스에 의한 질병으로 자돈이나 육성돈이 이 병에 걸리면 기침,...
[Quipu Issue Paper] Bioinformatics Knowledge Management Ⅴ- Centralization for High-throughput Data Analysis
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연재 순서 1. Assembly 2. Variation study 3. Expression study 4. Epigenomics 5. Genome Annotation 6. Next Generation Bioinformatics 7. Data Manageme...